来自中国医学科学院/北京协和医学院分子学国家重点实验室、南京医科大学、中山大学肿瘤防治中心等机构的研究人员，通过全基因组关联研究技术，发现了三个全新的中国人群食管鳞状细胞癌（ESCC）易感位点。这一发现对于解析该疾病的分子机理及开发相关治疗策略具有重要意义。研究成果发表于《Nature Genetics》杂志。

领导该研究的是中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肿瘤研究所病因及癌变研究室主任林东昕教授。林教授曾于1998年获得国家杰出青年科学基金，2003-2004年度被评为卫生部有突出贡献中青年专家，享受国务院政府特殊津贴。其研究团队系统研究了致癌物代谢、DNA修复、细胞周期和凋亡控制、肿瘤免疫等系统的基因变异与食管癌、胃癌、结直肠癌等常见肿瘤发生和发展的关系。

全基因组关联研究是目前研究常见复杂性疾病易感基因或致病基因最重要和最热门的方法之一。在本研究中，研究人员运用高密度SNP芯片，在全基因组范围内检测了大样本量食管癌患者和正常对照者的基因变异，并经过多中心、大样本量的病例-对照验证，发现5个染色体区段的变异（5q11的rs10052657、21q22的rs2014300、6p21的rs10484761、10q23的rs2274223和12q24的rs11066015、rs2074356和rs11066280）与食管癌发病相关。其中，位于染色体12q24的rs11066015、rs2074356和rs11066280变异与吸烟或/和饮酒存在显著的基因-环境交互作用。吸烟和饮酒是最明确的与食管癌发生相关的危险生活方式。

研究还显示，上述易感位点与食管癌风险具有累积关联作用，即携带危险变异越多，发生食管癌的风险越大。携带2至6个风险基因型的人，发生食管癌的风险逐渐由1.27倍增加至4.60倍。这些易感位点涉及ALDH2、RPL6、PTPN1、C12orf51、PDE4D、RUNX1、UNC5CL和PLCE1等基因，这些基因与乙醛和致癌物代谢、细胞增殖与凋亡等过程相关。该研究成果对深入了解食管癌发生的分子机理、食管癌的预警、早期诊断和预防具有重要意义。

这项研究成果是国内多家单位共同合作的结果，包括林东昕教授课题组、詹启敏教授课题组和刘芝华教授课题组等，吴晨等多名博士研究生参与该研究，为完成该研究做出了重要贡献。《Nature Genetics》是具有很高影响力的学术期刊，2009年影响因子为34.284。