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Blast工具的介绍和并行优化(5)

时间:2005-05-12 12:43来源:本站原创 作者:bioguider 点击: 2182次

图-3 Blast并行程序流程图

4.3.2.      Blast并行程序的性能

我们采用与Blast串行程序相同的数据进行了并行程序的测试,测试使用曙光2000中的四个节点,其中一个节点既作为主节点又用做子节点。其测试结果如下:

(责任编辑:泉水)

数据库

次数

步骤1消耗时间

步骤2消耗时间

步骤3消耗时间

 

FUN

13.7MB

1

142.3

8641.8

641.3

2

139.0

7986.9

622.0

3

139.9

8312.9

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