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 用显微镜做基因组测序(附图) 

时间:2005-08-10 10:50来源:科学时报 作者:bioguider 阅读:

研究人员用买来的现成设备和制剂,和比常规测序成本低得多的费用,测序了一个细菌的基因组。这个DNA测序技术是几个低成本测序方法之一,这些方法也许最终能使用低于1000美元的费用测量个人的人类基因组成为现实。这个方法每碱基对的测序成本约是传统方法的1/10,主要是因为设备便宜、小型化以及反应的“共享”。

研究人员测序的是一个与已测出的大肠杆菌有明显遗传差异的大肠杆菌基因组,目的是为了研究遗传变异,这是不断增长的基因组“重新测序”趋势的一个例子。研究人员同时复制了上千个DNA片段,每个片段放在一个单微米珠上。大约1400万个这样的珠能被密集地排列在10美分硬币大小的面积里,珠上的DNA由计算机控制的显微镜来测序,这些显微镜比传统的测序仪便宜得多。根据含氮碱基在DNA序列的具体位置,DNA片段会发出四种颜色之一的光。同一序列几次通过所发出的彩色数据被照相机记录下来,输入到计算机中被解释成线性的碱基对序列。

研究人员然后将序列信息与参照基因组进行对比,找出遗传变异。《科学》网站发表的这篇论文用的材料和方法的详细补充,使其它实验室也能用现成设备建自己的测序系统。 (责任编辑:泉水)

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