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调控生物形状表达的新方法

时间:2005-09-30 08:43来源:《自然-方法学》 作者:bioguider 点击: 201次
        利用随机混和的锌指型转录因子库进行筛选,科学家找到了调控特定显性性状表达的靶基因

        转录因子在蛋白质家族中具有非凡的影响力。它们通过调控基因表达来决定细胞的显性特征。利用这种功能,科学家目前已经对这些蛋白质进行工程化改造,从而来调节基因的表达。

        锌指型转录因子家族尤其易于修正,因为它们的组成成份包括一些确定的片段,或者是那些与特定DNA序列联结的锌指示剂,因此它们能够筛选出自己所调控的基因。通过对三、四种已知的片段进行组合,就很容易获得一个人工转录因子库。韩国ToolGen公司的Jin-Soo  Kim一直从事这种文库的研究工作,他在对真核细胞生物的研究中论证了人工转录因子能够调节基因的表达并改变显性表达。然而,一个显然的问题是:如何直接鉴别导致获得性显性的靶基因?最近发表在《细菌学期刊》上的一篇论文报道说,Kim的研究小组提出了一种直接将人工转录因子、靶基因和显性形状表达联系起来的实验方法。

        为便于研究,Kim的研究小组从基因组信息不太复杂的细菌着手,而将那些更为复杂的真核细胞生物暂时放在一边。他们通过在大肠杆菌中进行锌指型文库的克隆表达,对在摄氏50度高温下仍能生长的嗜热菌进行了分析,找到了其中一种能诱导所需的显性特征进行表达的人工转录因子。为了寻找靶基因,他们对转录因子和DNA活性片段进行交联实验,对相关蛋白质进行免疫沉淀反应实验,然后对所结合的DNA进行测序研究。通过将自己的研究结果与那些利用计算机对包含特定锌指型结构的蛋白质进行特定靶点预测的结果进行对比,他们找到了靶基因,发现这些人工转录因子能用于直接识别那些可调控特定显性表达的靶基因。

        Kim指出,这种新方法用途十分广泛,他已经利用该方法预测出了许多特征各异的显性性状。他将自己的这一工作形容为“在工业界和学术界搭建了一座桥”。他说:“工业界的人士通常关心有利润可图的显性形状表达、、、学术界的人士则有兴趣寻找那些可诱导显性表达发生改变的基因。我们解决的是如何提高显性性状表达这一问题,因而我们能鉴别出靶基因来。”

        然而,要使得工业界和学术界都认可的话,需要拿出更有力的证据来,那就是要在真核细胞生物系统中也找到基因和显型的这种直接关系。这也是Kim的研究小组下一步工作的重点。



        注:亦农译自2005年第九期《自然-方法学》,版权为英国NPG出版集团所有。 (责任编辑:泉水)
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