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美设计出改良柑橘类水果品种的基因芯片

时间:2006-03-06 11:28来源:生物通 作者:bioguider 阅读:
        据Eurekalert网站2006年3月2日报道,美国加州大学河畔分校的研究人员与Affymetrix公司合作开发出一种柑橘类基因组芯片,它将能帮助改良柑橘类植物的品种,并带来更好地管理柑橘类植物的方法。

        通过确定与口味、酸度和病害等有关的基因在柑橘类植物组织中的表达,该芯片可以向研究人员提供一些有用的信息,从而矫正目前存在的问题并对水果进行改良。这种柑橘类基因组芯片将被用于研发新的诊断工具,改良柑橘类产业和收获后的水果处理,并将有助于理解柑橘类植物疾病的根本机制。研究人员还将研究与柑橘类产品有关的一些特征,如便于剥皮、无籽、美味成分、害虫和疾病控制、营养特征和繁殖生长。

        据加州大学河畔分校生物学和植物科学系的遗传学教授、研究项目负责人迈克-卢斯称,这些柑橘类基因组芯片将帮助他们快速检查柑橘类植物的特征,如果一个特征给消费者带来问题,例如不喜欢的口味,他们可以确认与这种特征相关的基因,并通过对基因的处理来改善口味。他还称,这种芯片还可帮助他们解决柑橘类植物的病害问题,当一棵柑橘树受到一种病毒的攻击,芯片可以帮他们发现柑橘树的细胞中发生了什么变化。另外,使用这种芯片还能使研究人员更好的了解当柑橘类水果成熟并被冷藏时,细胞水平的变化,这最终将帮助研究人员找到更好办法来储藏这些已改良口味的水果。

        柑橘类基因组芯片是由Affymetrix公司制造的,它由一个玻璃晶片制成。在它上面,有近100万种不同的柑橘类DNA片段被存放在一个栅格或微阵列中,生产方法类似于电脑芯片。这种玻璃晶片被装在一个比一张信用卡小一点的塑料容器中。

        当使用芯片时,研究人员要纯化来自植物组织的总RNA(它反映在组织中表达的基因),再将RNA进行化学标记,接着用RNA样本“清洗”芯片。如果一种基因在组织中表达,它的相应RNA将与芯片中的相应DNA序列结合。由于被标记,结合的RNA将有一种明显的记号,就像一个计算机屏幕上的明亮和模糊像素。对芯片中发出信号的这段DNA的分析就显示出哪种基因正在组织中表达。

        这种芯片是第一个商业化的柑橘类基因组,它对2万多种不同基因的表达进行分析。这种基因组还将被用于研究柑橘的详细基因图谱,它将帮助研究人员定位许多基因,而这些定位信息将使帮助开发优良的新品种。加州大学河畔分校的另一名教授蒂莫西-克劳斯称,采用公开的柑橘类基因序列来开发一种全新的工具不仅将有利于所有柑橘类植物研究人员,而且有助于推动当地和全世界的柑橘类水果产业的发展。



英文原文链接参见:http://www.eurekalert.org/pub_releases/2006-03/uoc--urd030106.php



        加州大学河滨分校的研究人员与Affymetrix公司合作设计出一种称为GeneChip  柑桔基因组芯片(Citrus  Genome  Array)的新型芯片。这种芯片能够促进柑桔类植物的多样性并因此为人类更好地操纵它们提供了途径。例如,通过帮助确定出在一种柑桔组织中被开启的基因或者与味道、酸度和植物病害有关的基因,这种芯片能够提供对研究人员矫正柑桔品质问题非常有帮助的信息。

        这种柑桔芯片将会被用于开发新的改善柑桔种植和收获后果实处理的新诊断工具,并且还有助于研究人员了解柑桔病害的病因。研究人员将会研究与柑桔产业有关的特性,例如容易拨皮、无籽、风味、害虫和疾病控制、营养成分和产量。

        GeneChip  柑桔基因组芯片由一个玻璃片构成,在这个玻璃晶片上排列着接近100万个不同的柑桔DNA片段。这个玻璃晶片被放置在比信用卡稍微小点的塑料容器中。

        为了使用这个芯片,研究人员纯化了植物组织中的总RNA、创造出这些分子的一种带有化学标记的拷贝,然后用RNA样品“冲洗”该芯片。如果一个基因在被检组织中表达了,那么它的对应的RNA将会存在并与芯片上的互补DNA序列结合。被结合的RNA的位置因为标记物的存在而能被确定出来。(责任编辑:泉水)
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