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抗癌挑战系列:创建癌症“谷歌全景图”

智能手机的基本软件除了聊天、视频、购物、阅读等娱乐和工作功能外,百度地图、谷歌地图也已成为必不可少的智能应用。通过地图检索,我们能够轻松辨识所处位置,获取目的地的方位、距离和路线。

现在,科学家将类似的思路应用于癌症研究,通过构建癌症的“谷歌全景图”(Google Street View),实现对癌症的精准预测和治疗。这一构想于2015年被列入英国癌症研究中心启动的抗癌“七大挑战”之中。科学家希望通过构建肿瘤的三维地图,从分子和细胞水平共同研究癌症。

“全景图”:从细胞到分子,绘制肿瘤微环境

一个成型的肿瘤相当于一个复杂的器官。它不仅由肿瘤细胞组成,还包括基质细胞、炎症细胞、脉管系统和细胞外基质(ECM),所有这些构成一个生态系统,称为肿瘤微环境。其中,血管作为进入肿瘤的通道,为肿瘤生长提供营养,甚至成为癌细胞逃逸和扩散的路线。

过去的研究仅针对这一系统的某些组件,常常遗漏重要信息。例如,通过研究癌变细胞,科学家可以针对性地找到突变基因,但这一病变因子并不能完全揭示细胞癌变的机理。

多年来,研究人员借助显微、超声等成像技术获取癌变组织图像,通过活检等分析手段寻找病变因子,致力于癌症的诊断和治疗。然而,我们虽然知道肿瘤的位置和边界,却不了解其内部结构,也不清楚“坏细胞”如何影响正常组织。

为了更好地了解肿瘤,科学家提出了构建癌症“全息图”的挑战。这个特殊的“地图”将包含肿瘤的位置、内部细胞结构、癌变细胞与外界的联系以及基因组信息的变化。

随着成像技术的发展,我们已经能够获取肿瘤特定区域的高分辨率图像,为切除手术或放疗等治疗提供精准定位。同时,生物分子技术的进步使科学家得以验证细胞内蛋白质、DNA之间或内部的相互作用,为揭示癌变机制提供了可能。

从肿瘤边界到细胞内部结构,我们可以搭建出肿瘤的“全景图”。然而,类似于地图缩放,我们需要将宏观与微观联系起来,这是一个重要挑战,涉及大数据的处理。每个肿瘤都配备一套基因组数据,包括每个癌变细胞和周边正常细胞。科学家需要分析这些癌变细胞的基因差异,以及癌变细胞与正常细胞之间的基因差异。

(责任编辑:泉水)