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自然通讯:科学家推动结构生物学进入大数据时代

发表在《自然通讯》(Nature Communications)上的一篇文章中,来自圣路易斯大学的结构生物学家揭示了一个新型数据共享“联盟”如何帮助科学家快速分享研究发现并从中获益。

研究者Enrico Di Cera表示,他们开发了一种新型的结构生物学数据网格,可以存储、搜索和下载相关的结构生物学数据库。这种新型数据存储库能有效帮助科学家复制早期研究发现,并加速后续研究进程。该数据库的开发是一项革命性进展,最终研究者将利用众多结构生物学家研究的数据,从事更大规模、更深入的研究。

X射线晶体学技术是结构生物学中的核心工具,它使科学家能够在原子水平分辨率下确定蛋白质、核酸及其他小分子的结构。理解蛋白质结构有助于阐明疾病根源,并为开发新型治疗方法提供思路。晶体学家通常会在学术期刊上分享研究发现,并利用标准数据库(如蛋白质数据银行,PDB)进行数据处理。

这种新型结构生物学数据网格存储库利用计算集群的分布模型支持原始实验数据的存档。其优势包括快速获取原始实验数据以进行更深入的研究和探索。随着数据收集过程日益简化,以结构生物学数据网格呈现的资料文件将逐渐成为主流。

在本研究中,研究人员对存储库中的数据进行了初步分析,发现该数据存储库能有效帮助科学家对早期实验数据进行再处理,从而为结果复现提供机会,同时改善当前研究模型并筛选潜在错误。Di Cera最后表示,这种数据网格将为高层次的结构生物学研究提供支持,他们很自豪能成为这项研究的一部分,利用大数据进行更深入的科学探索。

(责任编辑:泉水)