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金域检验首席科学家于世辉:基因诊断在肿瘤临床使用中的注意事项

基因检测技术被誉为实验诊断领域的革命。随着高通量测序、全基因组芯片扫描等技术的普及,医疗模式发生了巨大改变。基因检测在疾病诊断、预后评估、风险分层及治疗效果监测中扮演着越来越重要的角色。

金域检验作为国内大型第三方医学检验机构,在香港和大陆共设有31家实验室。其临床基因组检测中心专注于肿瘤个体化医疗、遗传性疾病诊断及优生优育服务。

近日,记者就“如何做好分子诊断并惠及民生”等问题,采访了美国医学会医学遗传学学会注册临床遗传学家、金域检验首席科学家兼临床基因组检测中心医学总监于世辉博士。

于博士,您好!您在基因诊断领域经验丰富。请问当前基因诊断在肿瘤临床使用中有哪些需要注意的问题?

于世辉:最近我注意到,有人误以为基因诊断就是基因测序。实际上,核型分析、荧光原位杂交(FISH)以及热门的NGS都是常用技术。我认为需要多种技术结合才能获得精准结果,新技术并非万能。例如,世界卫生组织白血病和淋巴瘤诊断指南明确指出,任何类型的白血病和淋巴瘤都不能仅用单一技术进行基因检测。NGS虽能发现新突变位点,提供大量临床信息,但无法替代其他技术。金域作为负责任的机构,会根据疾病具体情况设计检测方案,在提高检出率的同时降低患者费用。第三方检验机构必须平衡患者承受能力和医生解读结果的能力。

精准医疗在肿瘤靶向药物治疗方面取得了显著进展。靶向药物如伊马替尼的应用,推动了更多靶向药物的研发和临床使用。但除了精准治疗,还应重视精准诊断和预后判断。

NGS在哪些领域已有成熟应用?未来前景如何?

于世辉:NGS在肿瘤和遗传性疾病领域均有应用,在遗传性疾病诊治中更为成熟。目前肿瘤基因测序主要用于靶向药物治疗。对于遗传性疾病,全外显子组或全基因组测序发现了大量新致病基因,使许多病因不明的疾病得以确诊。例如,在核型分析正常的基础上,全外显子测序的检出率可达25%~28%,这在十年前难以想象。因此,NGS为遗传性疾病诊断带来了革命性突破。

基于NGS的无创产前检测(NIPT)自卢煜明教授发现以来,经过十几年发展,已获政府和医院认可,成为产前检测的重要手段。但目前NIPT主要用于13、18、21号染色体三倍体检测,并探索用于几种常见微缺失综合征。美国妇产科指导性建议不推荐用NIPT检测微缺失综合征。人类遗传性疾病还包括8000多种单基因病。有科学家考虑NIPT能否同时检测所有单基因病致病位点。但技术上,母亲外周血中胎儿DNA含量很少,难以达到可靠准确度。尽管理论可行,但实现胎儿单基因病筛查仍面临技术、伦理及疾病认知等挑战,从技术成型到临床应用还有很长的路。

金域检验成为首批基因检测示范中心,请分享经验。

于世辉:国家正逐步放宽政策,鼓励企业、事业单位和高校开展基因检测服务。我们在国内标准出台前,以欧美规范严格要求自己,力求科研先行。当政策出台时,我们能够成为行业标准先行者,并帮助同行做好相关工作。金域拥有成熟技术、完善平台、广泛服务网络以及各层次懂得遗传基因组检测规范、了解世界发展方向的领导团队。因此,万事俱备,当机会来临时,我们把握住了。

获批示范中心是对我们多年工作的认可。我们将继续遵守国家法律法规和行业标准,与全国多所高校合作,做好科研技术储备,并保持企业短期、中期和长期发展规划不变。

金域如何将基因检测惠及于民?

于世辉:我认为基因检测要做到更精准、更“价廉物美”才能惠及于民。我国新生儿筛查主要使用质谱等技术。美国NIH约两年前就在探讨用NGS进行新生儿筛查。美国Parabase Senomics公司已将NGS应用于新生儿筛查,对544个基因的准确率达100%。

美国多年前已在临床使用全外显子组测序。我在西雅图儿童医院工作时,常与其他分析人员一起解读测序报告,但花费大量时间和人力后,仍难以获得有效结果。太多基因突变被检测出来,但许多突变的临床意义尚不明确。人类基因组有两万多个编码基因,目前只能解释5000多个基因与疾病的关系。两年前ACMG大会上,科学家提出医学外显子组概念,即针对已知的5000多个基因测序并解释。这降低了成本,更具目的性,短期内更适合临床遗传性疾病诊断。这些数据积累将为未来用基因组测序进行新生儿遗传病筛查奠定基础。

(责任编辑:泉水)