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基因表达梯度揭示全脑连接图谱,验证化学亲和理论

基因表达梯度揭示全脑连接图谱,验证化学亲和理论

神经回路的复杂性及其基因设计与布线机制,一直是神经科学领域的重要研究方向。近日,日本名古屋大学的科学家在《美国国家科学院院刊》发表了一项研究,首次通过基因表达梯度构建了全脑连接图谱,并验证了诺贝尔奖得主罗杰·斯佩里提出的化学亲和理论。

SPERRFY工具:解码大脑的基因连接图谱

研究团队开发了一种名为SPERRFY的机器学习工具,用以分析小鼠大脑的神经连接模式。该工具整合了两个关键数据集:一个详细描绘了小鼠大脑各区域之间的连接关系,另一个追踪了763个基因在213个脑区中的活性水平。通过分析基因表达梯度,SPERRFY能够预测脑区之间的连接关系,并构建出全脑布线图。

资深作者Naoki Honda教授解释道:“基因表达梯度形成了每个脑区的独特分子身份,这些身份通过SPERRFY工具得以解码,从而揭示了神经连接的规律。”研究显示,基因表达梯度的预测性能分数高达0.88,显著优于基于物理距离的预测模型(得分约为0.70)。

验证化学亲和理论,拓展至全脑

这项研究为斯佩里1963年提出的化学亲和理论提供了重要支持。斯佩里认为,神经元通过分子浓度梯度寻找连接伙伴,类似于神经纤维的“分子GPS系统”。虽然这一理论已在视觉和嗅觉系统中得到验证,但在全脑范围内的适用性尚未明确。得益于SPERRFY工具的开发,研究团队成功验证了这一理论在全脑复杂连接中的作用。

未来展望与应用潜力

研究还发现,部分基因表达梯度与神经生长引导基因的活性模式密切相关,为进一步探索大脑布线的分子机制提供了重要线索。研究人员表示,该方法可扩展应用于其他物种,包括人类、狨猴和果蝇,帮助科学家理解不同物种间的分子布线原理及其演化过程。此外,SPERRFY有望揭示大脑连接中断与神经发育障碍之间的关系,为相关疾病的治疗提供新思路。

参考文献: Jigen Koike, Kenta Kobayashi, Shohei Takemoto, Yutaro Matsuura, Junichi Hata, Yasuhiro Go, Naoki Honda. Gene expression gradients encode a comprehensive wiring map of the mouse brain. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024; DOI: 10.1073/pnas.2319200121

(责任编辑:scinews)