一项突破性研究揭示了人类微生物组传播的精确环境与物理动力学，证明家庭同居是菌株水平细菌定植的主要载体。研究团队分析了来自意大利和斐济207个家庭的430人的口腔和肠道宏基因组数据，覆盖了截然不同的地理和文化背景。
实证追踪数据颠覆了传统的遗传继承假设，揭示同居者之间共享的微生物菌株远多于与周围社区成员共享的，且完全独立于生物学亲缘关系。关键的是，该研究暴露了一个危险的代谢关联：传播性最强的特定细菌菌株与2型糖尿病、不良心血管代谢健康以及结直肠癌发生的生物标志物在结构上相互关联。
研究量化了亲密接触传播的动力学：浪漫伴侣之间的口腔微生物组重叠显著增加，直接由接吻的机械物理接触驱动。浪漫伴侣平均共享44%的口腔微生物菌株，而普通同居者为26%，不同家庭之间则为0%。宏基因组菌株追踪建立了日常传播的明确基线：同居者平均共享19%的肠道菌株和26%的口腔菌株，而同一社区不同住所的个体仅共享6%的肠道菌株和0%的口腔菌株。
资深作者、意大利特伦托大学计算生物学家Nicola Segata博士指出一个关键的生理细微差别：虽然人与人之间的微生物交换在所有环境中都非常高，但最终的系统性表达严格受控于个体独特的组织微环境是否允许这些外来菌株定植和存活。
研究还揭示了一个令人不安的进化特征：最擅长在宿主间传播的特定肠道菌株与系统性炎症生物标志物、不良心血管代谢健康以及2型糖尿病的发生直接相关。在口腔中，传播速度最快的物种包括两种与结直肠癌发病机制密切相关的微生物，以及一系列机会性病原体，这些病原体在免疫功能低下个体中可能引发致命感染。
第一作者、计算生物学家Vitor Heidrich表示：“我们决定与谁共享家园，会对我们的微生物组产生巨大影响，这对健康具有潜在后果。”这些自然传播指标为优化合成微生物组设计提供了直接蓝图。通过分离这些与疾病相关的菌株在人类宿主间艰难旅程中生存的精确表型特征，药理学家可以设计出具有更高定植成功率的治疗性益生菌和粪菌移植方案。