描述 该文库为L. pennellii文库。粘粒文库由MboI部分消化的总基因组DNA构建,经蔗糖梯度分级分离,选择约15-30 Kb的片段。DNA被连接到粘粒载体T04541中。该载体是一种双元载体,具有左右边界序列和用于植物筛选的NPTII基因,同时带有四环素标记用于细菌筛选。 步骤 1. 挑取一个单菌落,接种到10 ml LB培养基(含适当抗生素)中,培养6-8小时。 2. 将培养物转移至1升LB培养基(含抗生素)中,37°C振荡过夜培养。 3. 4000 rpm离心15分钟。 4. 用20 ml溶液I(50 mM D-葡萄糖,25 mM Tris-HCl,10 mM EDTA)重悬沉淀,转移至250 ml离心管中。 5. 冰上孵育5分钟。 6. 此后仅使用塑料移液管!加入50 ml新鲜配制的溶液II(0.2 N NaOH,1% SDS),轻轻混匀。 7. 冰上孵育5分钟(切勿超过!)。 8. 加入37.5 ml溶液III(8 M乙酸铵),轻轻混匀直至出现白色絮状物。 9. 冰上孵育10分钟。 10. 使用GSA转子,10000 rpm离心30分钟。 11. 用四层纱布过滤上清液至新离心管中。 12. 加入0.6倍体积的异丙醇(70 ml),混匀,室温孵育20分钟(延长至1小时效果更佳)。 13. 使用GSA转子,10000 rpm离心20分钟。 14. 保留沉淀,擦干管口(管壁上也有不易看见的沉淀)。用4 ml去离子水重悬沉淀,转移至聚丙烯管中,确保沉淀充分重悬。 15. 加入8 M乙酸铵,轻轻混匀1分钟。 16. 冰上孵育10分钟。 17. 使用HB-4转子,8000 rpm离心10分钟。 18. 转移上清液至新管中。 19. 加入6 ml异丙醇,轻轻混匀(可在此步于-20°C过夜,或室温孵育15分钟)。 20. 8000 rpm离心10分钟。 21. 保留沉淀。 22. 用70%乙醇洗涤:加满管,离心至5000 rpm,弃去上清。 23. 用1 ml去离子水重悬沉淀。 24. 加入20 μl RNA酶A(5 mg/ml),37°C孵育30分钟。 25. 加入580 μl去离子水。 26. 加入400 μl 4 M NaCl,轻轻混匀。 27. 加入2 ml 13% PEG 8000,轻轻混匀。 28. 冰上孵育1小时。 29. 80000 rpm离心20分钟。 30. 保留沉淀,用70%乙醇如前洗涤。 31. 干燥试管,用3.3 ml去离子水充分重悬。 32. 加入1.7 ml 8 M乙酸铵,轻轻混匀。 33. 酚/氯仿/异戊醇抽提,台式离心机离心5分钟。 34. 如不干净,重复步骤33。 35. 氯仿/异戊醇抽提两次。 36. 加入2.5倍体积的100%乙醇。 37. 10000 rpm离心30分钟。 38. 用70%乙醇如前洗涤。 39. 干燥,用200 μl去离子水重悬DNA。 配方 (原文未提供具体配方,此处保留空白) 耗材 (原文未提供具体耗材,此处保留空白) 提示 (原文未提供具体提示,此处保留空白) (责任编辑:泉水) |