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PAH基因AluI多态性检测方法

PAH AluI多态性是苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因第7外显子中的一个限制性片段长度多态性(RFLP)位点,常用于遗传连锁分析,特别是在苯丙酮尿症(PKU)的基因诊断中。该多态性通过AluI限制性内切酶消化PCR扩增产物进行检测。

实验步骤

模板:基因组DNA,100-200 ng/反应(25 μL体系)。

引物:

  • 引物1(PAHALU333):5' CTTGCACTGGTTTCCGCCTC 3',100 ng/反应
  • 引物2(PAHALU237):5' CCCAAACCTCATTCTTGCAGCA 3',100 ng/反应

dNTPs:终浓度200 μM each。

缓冲液:终浓度1.50 mM MgCl₂,50 mM KCl,10 mM Tris-HCl pH 8.4。

Taq DNA聚合酶:0.5 U/反应(推荐使用Perkin-Elmer Amplitaq DNA聚合酶,5 U/μL,货号N808-0145)。

PCR循环程序:95°C预变性5分钟;95°C 30秒,59°C 30秒,72°C 30秒,共30个循环;最后72°C延伸5分钟。

产物大小:PCR产物为213 bp。经AluI酶切后:

  • AluI位点纯合子存在:124 bp、59 bp和30 bp片段
  • AluI位点纯合子缺失:154 bp和59 bp片段
  • 注:59 bp片段为恒定片段

注意事项:确保模板DNA质量良好,避免RNA污染。PCR产物需经琼脂糖凝胶电泳或聚丙烯酰胺凝胶电泳分离后,用溴化乙锭或SYBR Green染色观察。

(责任编辑:泉水)