人类基因组中病毒包膜基因的序列多态性研究
时间:2005-09-14 09:41 来源:BMC Genomics 作者:BMC Genomics 点击:次
人类基因组中携带着大量类前病毒序列,即人类内生性逆转录酶病毒(HERVs),这些序列是远古时期活性逆转录酶病毒感染后留下的基因组痕迹。尽管大多数HERVs已失去功能,但部分开放阅读框仍存在于逆转录病毒包膜基因中。目前,已鉴定出16个这样的包膜基因,其中几个在灵长类动物进化过程中被保留,并可能被宿主利用以行使生理功能。一项发表在《BMC Genomics》上的研究对人类基因组中病毒包膜基因的序列多态性进行了深入分析。 为了进一步解析这些“远古”序列的状态,研究团队对91名白种人中的12个包膜基因进行了测序。基因组分析显示,HERV-W和HERV-FRD包膜基因具有高度的序列保守性,仅发现两个非同义单核苷酸多态性(SNP)。研究人员利用ex vivo融合分析研究了每个等位基因,证明这些SNP不影响融合功能。 另一个包膜蛋白表现出不定数量的多态性,并出现了终止密码子和/或移码突变,但并非所有突变都导致功能丧失。此外,灵长类动物中直系同源基因的序列保守性分析表明,三个env基因在整个进化过程中保持了充分的编码状态,提示它们可能具有生物学功能。 这项研究强烈暗示,部分包膜编码序列是真实的基因,而非无功能的假基因。研究还为阐明内生包膜基因在病原体感染中作为感受因子的潜在作用提供了新信息。 (责任编辑:泉水) |