我国首次揭示雄激素受体基因组结合位点图谱
时间:2010-10-21 00:00 来源:Molecular Endocrinology 作者:胡双纲等 点击:次
10月13日,内分泌领域权威期刊《Molecular Endocrinology》在线发表了上海生科院生化与细胞所张永莲研究组的最新研究成果:雄激素受体在小鼠附睾基因组结合位点的鉴定。该研究首次在生理条件下绘制了雄激素受体(AR)的全基因组结合位点图谱,为理解雄激素在附睾中的调控机制提供了重要基础。 附睾是精子成熟和储存的关键器官,其结构和功能的维持以及基因表达均高度依赖于雄激素。雄激素的作用由雄激素受体(AR)介导,AR与雄激素应答元件(ARE)结合后调控下游基因表达。附睾是体内AR表达量最高的器官之一,此前通过cDNA芯片研究已鉴定到许多附睾表达的基因受雄激素调控,但AR在附睾内的直接靶基因仍知之甚少。 博士研究生胡双纲等人在张永莲院士和刘强副研究员指导下,利用ChIP-seq方法检测了小鼠头部附睾(AR高表达区域)中基因组水平的AR结合位点。共鉴定到19377个AR结合位点,其中大部分位于基因间区域和内含子区域,仅7%位于转录起始位点上游5kb区域内。这些结合位点关联了8190个靶基因,参与广泛的生理过程。Motif分析显示,94%的AR结合位点含有保守的雄激素应答元件,并富集了潜在的协同因子结合motifs,包括已知的NF1位点和新发现的AP-2位点,提示NF1、AP-2与AR之间存在协同调控。令人惊讶的是,这些结合位点在物种间保守性不高。该研究还在单基因水平阐明了雄激素受体对某些附睾基因表达调控的新机制。 本工作首次揭示了雄激素受体在生理条件下的基因组结合位点图谱,加深了对AR在附睾头部调控网络的理解,同时是对此前在前列腺癌细胞系和原代肌细胞等非生理条件下AR结合位点研究的有力补充和扩展。 该研究得到国家科技部、国家自然科学基金委、中国科学院和美国NIH的经费资助。 (责任编辑:glia) |