浙江大学团队构建拟南芥分子相互作用网络数据库并开展系统生物学分析
时间:2011-04-02 00:00 来源:浙江大学生命科学学院 作者:陈新课题组 点击:次
浙江大学生命科学学院研究团队成功构建了迄今为止最全面的拟南芥分子相互作用网络预测数据库,并提出了基于网络拓扑结构的系统生物学分析方法。相关研究成果发表在植物学领域权威期刊《The Plant Cell》上。 该研究由浙江大学生命科学学院陈新副教授主持。陈新副教授毕业于上海交通大学,后在新加坡国立大学获得博士学位,主要研究方向涵盖计算机辅助药物设计、生物信息学表示与数据挖掘、统计与机器学习方法在生物学中的应用,以及代谢与调控网络分析。 研究题为《The predicted Arabidopsis interactome resource and network topology-based systems biology analyses》,通过整合多种分子相互作用证据,建立了覆盖拟南芥约24%潜在相互作用的预测网络,且单个预测相互作用的可靠性超过40%。 该预测网络虽覆盖有限,但已能有效反映生物途径和生物过程之间的复杂关联,支持生物途径交互关系分析、基因功能预测及识别表达变化不显著但关键的调控基因等多种系统生物学应用。许多后续发表的生物学关联均可通过该网络的拓扑结构得到验证。 陈新课题组目前正致力于重建人类分子相互作用网络,旨在解析多成分药物协同作用的分子机制,推动药物多靶标协同调控理论的发展。 (责任编辑:glia) |
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