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美研究者完成“生命暗物质”基因组测序

2013-06-14 16:55 克雷格·文特尔研究所 美国《国家科学院学报》 阅读 0
核心摘要: 美国克雷格·文特尔研究所利用单细胞基因组捕获技术,成功完成了对“候选门TM6”细菌的基因组测序。这种被称为“生命暗物质”的细菌广泛存在于水环境中,但无法在实验室培养。测序结果显示其无法制造氨基酸,可能依赖寄生或共生生存。该研究为探索难以培养的微生物提供了新方法,有助于揭示其生态功能。

正当物理学家苦苦寻找宇宙暗物质之际,美国研究人员近日报告说,他们完成了对“生命暗物质”的基因组测序。所谓“生命暗物质”,指的是那些无法在实验室培养、但广泛存在于环境中的微生物,它们如同宇宙暗物质一样难以捉摸。

1996年,科学家首次发现了一种名为“候选门TM6”的细菌。这种细菌广泛存在于水环境中,却无法在实验室中培养,除了其标志性的16S核糖体RNA基因外,科学界对它的生命活动特点几乎一无所知。正因此,“候选门TM6”细菌被称为“生命暗物质”。

美国克雷格·文特尔研究所的研究人员在新一期美国《国家科学院学报》上报告说,他们采用能从单个细胞中捕获基因组的自动化技术,从一家医院休息室的水槽下水管生物膜上收集了TM6细菌,并使用DNA拼接方法成功重建了该细菌的基因组。这一技术突破使得研究那些难以培养的微生物成为可能。

测序结果表明,这种细菌无法制造氨基酸,可能需要寄居在生物膜中或者单细胞微生物内部。这种寄生或共生关系可能是其生存的关键。不过,目前尚不清楚TM6细菌对人体是否有害,需要进一步研究。

研究人员表示,该研究成果或将有助于培养和研究类似微生物,从而进一步了解它们的生态特征和功能。这一进展也为探索微生物世界的“暗物质”开辟了新途径。

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