生物样本库,也被称为“生物银行”,其核心功能不仅是存储生物样本,更在于对样本及其相关临床信息进行全面的信息化管理。然而,生物样本库涉及多学科领域,信息化建设需要经历从专职到专业的转变。
在信息时代,生物样本库与大数据的结合至关重要。上海交通大学医学院附属新华医院教授王伟业指出:“如果样本没有信息的转化,其作为转化医学和个体化医学研究的宝贵资源也将成为一句空话。”他强调,信息化是生物样本库建设的下一个重点。
生物样本库的建设如同计算机操作:样本采集是“进口”,数据处理是“操作”,结果输出是“出口”。我国生物样本资源丰富,但资源应用的“出口”问题突出。王伟业表示,生物样本库必须与传统以单一课题需求为目的的样本储存有本质区别,但目前大多数样本库尚未实现质的改变。
国际上,生物样本库发展分为三个阶段:建立样本库、数据共享、形成资源网络。美国国家癌症研究机构的caTissue软件已成为全球最大的生物样本资源交流平台;法国则开发了短信服务系统,方便样本贡献者与样本库联系。然而,我国生物样本库大多停留在第一阶段,缺乏全国性网络,样本信息难以与临床信息整合,共享困难。
上海申康医院发展中心医疗事业部主任郑培永坦言:“中国的生物样本库数据共享就像戒烟一样,说起来容易做起来难。”理念认识上的问题导致信息化遇阻。英国学者建议,生物样本库应改变战略重点,从以样本为中心转向以信息为中心。
如何建立信息资源共享系统成为未来重点。复旦大学生物医学研究院研究员刘雷指出,在大数据时代,生命科学向数据驱动的科学发现模式发展,关键在于对生物大数据的解读和利用。王伟业强调,互联网和大数据是生物样本库信息化建设的重要元素,临床信息、生物样本和研究结果三大资源需通过互联网交流发挥作用。
为促进信息化,王伟业提出“平台化医学研究资源”理念,主张样本库发挥多元素枢纽作用,以平台模式运作。平台化需借助互联网进行信息交流,并涵盖临床疾病相关信息和正常个人健康档案资源。浙江大学转化医学研究院李昊旻博士则提议共建“生物医学研究协作网络”,快速匹配研究者需求,促进样本资源共享和利用。
从专职到专业是生物样本库发展的关键。王伟业表示,国内样本库常雇佣专职人员,但专职不等于专业。样本库涉及医学、生物学、分子生物学、冷冻保存技术、生物信息学等多个领域,从业者需通过专业化学习成为专业人员。信息化管理需要生物学和IT人员的紧密配合,不能仅依赖IT技术。
总之,生物样本库的信息化建设需要从专职走向专业,以数据为中心,借助互联网和大数据技术,实现资源共享和高效利用,从而推动现代医学研究的发展。