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张鹍教授在PNAS上发表新技术,提升单细胞测序精度

2017-10-30 15:23 张鹍教授 PNAS 阅读 0
核心摘要: 张鹍教授的团队在PNAS上发表了一项新的单细胞测序方法,通过微流体反应器法实现了对单细胞基因组的准确测序和单倍体分型,显著提高了测序的精度和准确性。该技术有广泛的应用前景,特别是在检测循环肿瘤细胞和体外受精胚胎筛选等领域。

张鹍教授的团队近期在PNAS发表题为《Ultra-accurate Genome Sequencing and Haplotyping of Single Human Cells》的研究,提出了一种新的单细胞测序方法,名为SISSOR(微流体反应器法单链测序)。

该方法通过利用微流体处理器将单个细胞的染色体DNA分离成正负双链,并将大片段随机分割成纳升级的组分,用于扩增和构建测序文库。这样可以实现对同源染色体的互补双链独立测序,从而提高单细胞测序的精度和准确性。

研究结果显示,SISSOR技术可以将单细胞测序错误率降低至10-8,并且单倍体片段平均可组装长度为500kb,重叠群contig达到N50大于7 Mb。该方法的优势在于它能够利用冗余和单倍体型信息纠正测序错误,从而提高测序的准确性和可靠性。

张鹍教授表示,SISSOR技术的应用前景广阔,可以用于对患者血液中循环肿瘤细胞进行准确检测,对体外受精的健康胚胎进行筛选,以及对经过基因组编辑的人体细胞进行检测,以达到治疗的目的。

随着单细胞测序研究的不断发展,SISSOR技术凭着其独特的单倍体型分析优势和超高的测序精度,将成为科研和临床领域的重要工具。

参考文献:

1. Single-Cell Whole-Genome Amplification and Sequencing: Methodology and Applications.

2. Ultra-accurate Genome Sequencing and Haplotyping of Single Human Cells.

3. Uniform and accurate single-cell sequencing based on emulsion whole-genome amplification.

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