18.1mol/L MgCl2溶液
【配制方法】
在800ml水中溶解203.4g MgCl2·6H2O,用水定容至1L,分装成小份并高压灭菌备用。
【注意】
MgCl2极易潮解,应选购小瓶(如100g)试剂,启用新瓶后勿长期存放。
19.β-巯基乙醇(BME)溶液
【配制方法】
一般得到的是14.4mol/L溶液,应装在棕色瓶中保存于4℃。
【注意】
BME或含有BME的溶液不能高压处理。
20.NBT溶液
【配制方法】
把0.5g氯化氮蓝四唑溶解于10ml 70%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃。
21.酚/氯仿溶液
【配制方法】
把酚和氯仿等体积混合后用0.1mol/L Tris·HCl(pH7.6)抽提几次以平衡这一混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆盖等体积的0.01mol/l Tris·HCl(pH7.6)液层,保存于4℃。
【注意】
酚腐蚀性很强,并可引起严重灼伤,操作时应戴手套及防护镜,穿防护服。所有操作均应在化学通风橱中进行。与酚接触过的部位皮肤应用大量的水清洗,并用肥皂和水洗涤,忌用乙醇。
22.10mmol/L苯甲基磺酰氟(PMSF)溶液
【配制方法】
用异丙醇溶解PMSF成1.74mg/ml(10mmol/L),分装成小份贮存于-20℃。如有必要可配成浓度高达17.4mg/ml的贮存液(100mmol/L)。
【注意】
PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤,吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。一旦眼睛或皮肤接触了PMSF,应立即用大量水冲洗之。凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。
PMSF在水溶液中不稳定。应在使用前从贮存液中现用现加于裂解缓冲液中。PMSF在水溶液中的活性丧失速率随pH值的升高而加快,且25℃的失活速率高于4℃。pH值为8.0时,20μmmol/l PMSF水溶液的半寿期大约为85min,这表明将PMSF溶液调节 为碱性(pH>8.6)并在室温放置数小时后,可安全地予以丢弃。
23.磷酸盐缓冲溶液(PBS)溶液
【配制方法】
在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g KH2PO4,用HCl调节 溶液的pH值至7.4加水定容至1L,在15lbf/in2(1034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min。保存于室温。
24.1mol/L乙酸钾(pH7.5)溶液
【配制方法】
将9.82g乙酸钾溶解于90ml纯水中,用2mol/L乙酸调节 pH值至7.5后加入纯水定容到1L,保存于-20℃。
25.乙酸钾溶液(用于碱裂解)
【配制方法】
在60ml 5mol/L乙酸钾溶液中加入11.5ml冰乙酸和28.5ml水,即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度为5mol/L的溶液。
26.3mol/L乙酸钠(pH5.2和pH7.0)溶液
【配制方法】
在80ml水中溶解408.1g三水乙酸钠,用冰乙酸调节 pH值至5.2或用稀乙酸调节 pH值至7.0,加水定容到1L,分装后高压灭菌。
27.5mol/L NaCl溶液
【配制方法】
在800ml水中溶解292.2g NaCl加水定容至1L,分装后高压灭菌。
28.10%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液
【配制方法】
在900ml水中溶解100g电泳级SDS,加热至68℃助溶,加入几滴浓盐酸调节 溶液的pH值至7.2,加水定容至1L,分装备用。
【注意】
SDS的微细晶粒易扩散,因此称量时要戴面罩,称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS,10%SDS溶液无须灭菌。
29.20×SSC溶液
【配制方法】
在800ml水中溶解175.3g NaCl和88.2g柠檬酸钠,加入数滴10mol/l NaOH溶液调节 pH值至7.0,加水定容至1L,分装后高压灭菌。
30.20×SSPE溶液
【配制方法】
在800ml水中溶解17.5g NaCl、27.6g NaH2PO4·H2O和7.4g EDTA,用NaOH溶液调节 pH值至7.4(约需6.5ml 10ml/L NaOH),加水定容至1L,分装后高压灭菌。
31.100%三氯乙酸溶液
【配制方法】
在装有500g TCA的瓶中加入227ml水,形成的溶液含有100%(M/V)TCA。
32.1mol/L Tris溶液
【配制方法】
在800ml水中溶解121.91g Tris碱,加入浓HCl调节 pH值至所需值。
pH HCl
7.4 70ml
7.6 60ml
8.0 42ml
应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值,加水定容至1L,分装后高压灭菌。
【注意】
如1mol/L溶液呈现黄色,应予丢弃并置备质量更好的Tris。
尽管多种类型的电极均不能准确测量Tris溶液的pH值,但仍可向大多数厂商购得合适的电极。
Tris溶液的pH值因温度而异,温度每升高1℃,pH值大约降低0.03个单位。例如:0.05mol/L的溶液在5℃、25℃、和37℃时的pH值分别为9.5、8.9和8.6。
33.Tris缓冲盐溶液(TBS)(25mmol/l Tris)
【配制方法】
在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl和3g Tris碱,加入0.015g酚并用HCl调至pH值至7.4,用蒸馏水定容至1L,分装后在151bf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸汽灭菌20min,于室温保存。
34.X-gal溶液
【配制方法】
X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。用二基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的贮存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中,装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏,并应贮存于-20℃。X-gal溶液无须过滤除菌。
杂交试验中用于降低背景的封闭剂
试剂
用途 Denhardt试剂 Northern杂交 使用RNA探针的杂交 单拷贝序列的Southern杂交 将DNA固定于尼龙膜上的杂交 Denhardt试剂通常配制50×贮存液,过滤后保存于-20℃。可将该贮存液10倍稀释于预杂交液(常为含有0.5%SDS和100μg/ml经变性被打断的鲑精DNA的6×SSC或6×SSPE)中。50×Denhardt液中含5g聚蔗糖(Ficoll,400型,Pharmacia)、5g聚乙烯吡咯烷酮和5g牛血清白蛋白(组分V”Sigmal),加水至终体积为500ml。 BLOTTO Grunstein-Hogness杂交 Benton-Davis杂交 除单拷贝序列Southern杂交以外的所有Southern杂交 斑点印迹 1×BLOTT(牛乳转移技术优化液,Bovine Lacto Transfer Technique Optimizer),是含5%胶脂奶粉和0.02%叠氮钠的水溶液,应保存于4℃。使用前可用预杂交液稀释25倍。BLOTTO不应与高浓度的SDS并用,因为后者会导致牛奶中蛋白质析出。如果杂交背景不合要求,可在杂交液中加入NP-40至终浓度为1%。BLOTTO不能用作Northern杂交的封闭剂,因为这一封闭剂中可能含有RNA酶,其活性之高使人无法接受。 注意:叠氮钠有毒性,取用时需戴手套小心操作。含叠氮钠的溶液应予明确标记。 肝素 Southern杂交 原位杂交 肝素(Sigma H-7005,从猪中提取的二级产品或相当等级的产品)用4×SSPE或4×SSC溶解配制成50mg/ml的浓度,保存于4℃。肝素在含有葡聚糖硫酸酯的杂交液中用作封闭剂的浓度为500μg/ml,在不含葡聚糖硫酸酯的杂交液中的浓度为50μg/ml。 经变性并被打断的鲑精DNA southern和Northern杂交 把鲑鱼精子DNA(Sigma,Ⅲ,盐钠)溶解于水配制成10mg/ml的浓度,必要时于室温磁力搅拌2~4h助溶。把溶液中NaCl的浓度调至0.1mol/L,并用酚和酚/氯仿各抽提一次,回收水相。合DNA溶液快速通17号皮下注射针头12次,以剪切DNA。加入2倍体积用冰预冷的乙醇沉淀DNA。离心回收DNA并重溶于水,配制成10mg/ml的浓度,测定溶液的OD260值并计算出精确的DNA浓度,然后煮沸10min,分装成小份保存于-20℃。使用前置沸水浴中加热5min,然后迅速在冰浴中骤冷。预杂交液中应含有100μg/ml经变性并被打断的鲑鱼精子DNA
六、常用凝胶的技术参数
1.葡聚糖凝胶的某些技术数据
种类
干颗粒直径(μ)
分子量分级范围
床体积毫升/克干分子筛
得水值 溶胀最少平衡时间(h)
柱头压力(kPa)(2.5cm直径柱) 肽及球形蛋白质 葡聚糖(线性分子) 室温 沸水浴 Sephadex G-10 40~ 120 ~700 ~700 2~ 3 1.0±0.1 3 1 Sephadex G-10 40~ 120 ~1500 1500 2.5~3.5 1.5±3.5 3 1 Sephadex G-25
粗级 100~300
(≈5~100目)
中级 50~150
(≈100~200目)
1,000~
5,000
100~
5,000
4~6
1.5±0.2
6
2
细级 20~800(≈200~400目)
超细 10~40 Sephadex G-50
粗级 100~200
中级 50~150 1,500~ 500~
细级 20~80 30,000 10,000 9~11 5.0±0.3 6 2
超细 10~40 Sephadex G-75 40~120 3,000~ 1,000~
超细 10~40 70,000 950,000 12~15 7.5±0.5
24
3
3.92~15.86 Sephadex G-100 40~120 4,000~ 1,000~
超细 10~40 1,500,000 150,000 15~20 10.0±1.0 48 5 2.35~9.41 Sephadex G-150 40~120 5,000~ 1,000~ 20~30
超细 10~40 400,000 150,000 18~22 15.0±1.5 72 5 0.88~3.53 Sephadex G-200 40~120 5000~ 1000~ 30~40 10~40 800,000 200,000 20~25 20.0±2.0 72 5 0.39~1.57
2.聚丙烯酰胺凝胶的技术数据
型号
排阻的下限
(分子量)
分级分离范围
(分子量)
膨胀后的床体积(ml/g干凝胶)
膨胀所需最少时间(室温,h) Bio-gel-P-2 1,600 200~2,000
3.8
2~4 Bio-gel-P-4 3,600 500~4,000
5.8
2~4 Bio-gel-P-6 4,600 1,000~5,000
8.8
2~4 Bio-gel-P-10 10,000 5,000~17,000
12.4
2~4 Bio-gel-P-30 30,000 20,000~50,000
14.9
10~12 Bio-gel-P-60 60,000 30,000~70,000
19.0
10~12 Bio-gel-P-100 100,000 40,000~100,000
19.0
24 Bio-gel-P-150 150,000 50,000~150,000
24.0
24 Bio-gel-P-200 200,000 80,000~200,000
34.0
48 Bio-gel-P-300 300,000 100~400,000
40.0
48
3.琼脂糖凝胶的技术数据
型号
琼脂糖含量
%(W/W)
排阻的下限
(分子量)
分级分离的范围(分子量)
生产厂家
Sepharose 4B
4
0.3×106~3×106
Pharmacia
Sepharose 2B
2
2×106~25×106
Sagavac 10
10
2.5×105
1×104~2.5×105
Seravac
Sagavac 8
8
7×105
2.5×104~7×105
Sagavac 6
6
2×106
5×104~2×106
Sagavac 4
4
15×106
2×105~15×106
Sagavac 2
2
150×106
5×105~15×107
Bio-gel A-0.5M
10
0.5×106
<1×104~0.5×106
Bio-Rad
Bio-gel A-1.5M
8
1.5×106
<1×104~1.5×106
Bio-gel A-5M
6
5×106
1×104~5×106
Bio-gel A-15M
4
15×106
4×104~15×106
Bio-gel A-50M
2
50×106
1×105~50×106
Bio-gel A-150M
1
150×106
1×106~150×106
4.各处凝胶所允许的最大操作压
凝胶
最大静水压(kPa)
Sephadex
G-10
9.8
G-15
9.8
G-25
9.8
G-50
9.8
G-75
4.9
5.琼脂糖凝胶浓度与线性DNA分辨范围
凝胶浓度(%)
线性DNA长度(bp)
0.5
1000~30000
0.7
800~12000
1.0
500~10000
1.2
400~7000
1.5
200~3000
2.0
50~2000
6.染料在变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速度
凝胶浓度(%)
溴酚蓝
二甲苯青FF
5.0
35bp
140bp
6.0
26bp
106bp
8.0
19bp
75bp
10.0
12bp
55bp
20.0
8bp
28bp
7.染料在非变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速度
凝胶浓度(%)
溴酚蓝
二甲苯青FF
3.5
100bp
460bp
5.0
65bp
260bp
8.0
45bp
160bp
12.0
20bp
70bp
15.0
15bp
50bp
20.0
12bp
45bp
七、氨基酸的特性
氨基酸名称 三字母缩写 单字母缩写质量 侧链电离的pHa值
结构式
丙氨酸(alanine)
Ala
A
89.09
精氨酸(arginine)
Arg
R
174.2
12.48