寡核苷酸标记是分子生物学实验中常见的一项技术,本文详细介绍了寡核苷酸标记的具体操作步骤。
实验步骤
1. 在微离心管中混合以下试剂:0.5 μL 变性缓冲液、50 ng 待标记的寡核苷酸(在 TE 缓冲液中)、用无水去离子水将总反应体积调整至 5 μL。
2. 将反应混合物在 70℃ 下孵育 5 分钟。
3. 将反应混合物置于冰上,并短暂离心以去除管盖上的冷凝水。
4. 按以下顺序向反应管中加入试剂:1.25 μL 10X 激酶缓冲液、0.5 μL 100 mM DTT、5 μL 10 uCi/μL [32P]ATP(注意!请参阅提示 #1)、0.75 μL(7.5 单位)T4 多核苷酸激酶。
5. 将反应混合物在 37℃ 下孵育 1 小时。
6. 向反应管中加入以下试剂:36 μL TE 缓冲液、50 μL 4.0 M 醋酸铵、1 μL 10 mg/ml tRNA、200 μL 100% 乙醇,涡旋混匀。
7. 以最大速度离心 10 分钟,使 DNA 沉淀。
8. 去除上清液,用 100 μL TE 缓冲液悬浮沉淀,取 1 μL 在闪烁计数器中用闪烁液计数(请参阅提示 #2)。
试剂配方
tRNA (10 mg/ml)、4.0 M 醋酸铵、TE 缓冲液(10 mM Tris, 1 mM EDTA, pH 8.0)、[32P]ATP (10 μCi/μL)、100 mM DTT、激酶缓冲液(10X,50% (v/v) 甘油,100 mM MgCl2,500 mM Tris, pH 9.5)、变性缓冲液(200 mM Tris, pH 9.5,1 mM EDTA,10 mM 精胺)。
注意事项
1. 注意![32P]ATP 是一种生物危害物质,请查阅其 MSDS 以获取正确的处理说明。
2. DNA 沉淀无需用 70% 乙醇洗涤。