摘要:本文详细介绍了一种利用Bst DNA聚合酶催化的放射性标记两步法单链DNA测序技术。该方法通过放射性标记的核苷酸延伸反应,实现对单链DNA的高灵敏度测序,适用于分子生物学研究中的DNA序列分析。
实验步骤:
1. 在微量离心管中配制延伸反应混合物,组分包括:750 ng M13模板DNA,2 μl Bst反应缓冲液,2 μl Bst核苷酸延伸混合物,1 μl引物(浓度2.5 ng/μl),0.5-1 μl放射性标记核苷酸([α-32P]-dATP或[α-35S]-dATP),1 μl稀释后的Bst聚合酶(0.1 U/μl),用无菌双蒸水补足至12 μl。
2. 将反应体系在67℃孵育2分钟,随后短暂离心以收集冷凝液。
3. 取2.5 μl反应液分别加入预先分装于V底微孔板中的四种碱基特异性终止混合物中。
4. 在67℃继续孵育10分钟,孵育结束后短暂离心,反应可在-70℃保存。
5. 通过加入4 μl琼脂糖凝胶加载染料终止反应,并在100℃加热5-7分钟。
实验材料:放射性标记核苷酸[α-32P]-dATP和[α-35S]-dATP购自Amersham,Bst聚合酶购自BioRad(货号170-3406),使用Bst稀释缓冲液进行酶的稀释。
技术背景: Bst DNA聚合酶具有较高的温度稳定性和强大的延伸能力,适合用于单链DNA的放射性标记测序。该方法通过放射性核苷酸的掺入,实现对DNA序列的灵敏检测,广泛应用于基因组学和分子遗传学研究。
该技术虽较早期,但其高灵敏度和特异性仍为部分特殊测序需求提供了有效手段。随着高通量测序技术的发展,放射性标记测序逐渐被替代,但在某些实验条件下仍有其独特价值。