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YAC文库筛选阳性克隆的详细实验方案

2005-07-18 00:00 未知 未知 阅读 0
核心摘要: 本文详细描述了YAC(酵母人工染色体)文库筛选阳性克隆的实验方案,包括文库构建背景、PCR反应体系、YAC超级池筛选及阳性克隆验证步骤。适用于分子生物学研究中利用YAC文库进行基因筛选和克隆的实验操作参考。

描述

本文库为L. esculentum(番茄)的VFNT Cherry和Rio Grande-PtoR品系文库。粘粒文库通过EcoRI部分消化总基因组DNA,克隆至pYAC4的BamHI位点构建,经CHEF凝胶电泳分级分离,筛选大小约为150-200 Kb的片段。文库的平均插入片段大小为50至400 Kb。

实验步骤

不同引物组合的测试反应

使用不同DNA来源作为测试模板及后续对照:

  • 基因组DNA制备(例如来自Mogeor、M-82品系)
  • RAPD反应后的克隆DNA片段
  • 筛选后cDNA文库中的克隆DNA插入片段

使用下文所述的YAC-PCR程序和PCR混合液。

YAC超级池筛选

1块96孔微量滴定板,包含来自384个不同YAC克隆的DNA制备物。

PCR混合液

DNA模板 1.0 μl
正向引物 2.0 μl
反向引物 2.0 μl
10X PCR缓冲液 5.0 μl
dNTPs 4.0 μl
Taq DNA聚合酶 2单位
H2O 35.0 μl
总体积 50.0 μl

YAC-PCR程序
步骤1 94°C 2.0分钟
步骤2 94°C 2.0分钟
步骤3 50°C 2.0分钟
步骤4 72°C 2.0分钟
步骤5 返回步骤2,45个循环
步骤6 72°C 5.0分钟
步骤7 4°C 保持

阳性YAC筛选

反应体系:

酵母细胞裂解液(作为模板)5.0 μl
Zymolase(1 mg/ml)5.0 μl
10X PCR缓冲液 2.0 μl
H2O 8.0 μl
总体积 20.0 μl
37°C孵育30分钟

加入PCR混合液:正向引物 1.0 μl
反向引物 1.0 μl
10X PCR缓冲液 3.0 μl
dNTPs 2.0 μl
Taq DNA聚合酶 1单位
H2O 22.0 μl

使用上述YAC PCR程序。

配方

(原文未提供具体内容)

耗材

(原文未提供具体内容)

提示

(原文未提供具体内容)

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