描述
本文库为L. esculentum(番茄)的VFNT Cherry和Rio Grande-PtoR品系文库。粘粒文库通过EcoRI部分消化总基因组DNA,克隆至pYAC4的BamHI位点构建,经CHEF凝胶电泳分级分离,筛选大小约为150-200 Kb的片段。文库的平均插入片段大小为50至400 Kb。
实验步骤
不同引物组合的测试反应
使用不同DNA来源作为测试模板及后续对照:
- 基因组DNA制备(例如来自Mogeor、M-82品系)
- RAPD反应后的克隆DNA片段
- 筛选后cDNA文库中的克隆DNA插入片段
使用下文所述的YAC-PCR程序和PCR混合液。
YAC超级池筛选
1块96孔微量滴定板,包含来自384个不同YAC克隆的DNA制备物。
PCR混合液
DNA模板 1.0 μl
正向引物 2.0 μl
反向引物 2.0 μl
10X PCR缓冲液 5.0 μl
dNTPs 4.0 μl
Taq DNA聚合酶 2单位
H2O 35.0 μl
总体积 50.0 μl
YAC-PCR程序
步骤1 94°C 2.0分钟
步骤2 94°C 2.0分钟
步骤3 50°C 2.0分钟
步骤4 72°C 2.0分钟
步骤5 返回步骤2,45个循环
步骤6 72°C 5.0分钟
步骤7 4°C 保持
阳性YAC筛选
反应体系:
酵母细胞裂解液(作为模板)5.0 μl
Zymolase(1 mg/ml)5.0 μl
10X PCR缓冲液 2.0 μl
H2O 8.0 μl
总体积 20.0 μl
37°C孵育30分钟
加入PCR混合液:正向引物 1.0 μl
反向引物 1.0 μl
10X PCR缓冲液 3.0 μl
dNTPs 2.0 μl
Taq DNA聚合酶 1单位
H2O 22.0 μl
使用上述YAC PCR程序。
配方
(原文未提供具体内容)
耗材
(原文未提供具体内容)
提示
(原文未提供具体内容)