2006年7月10日，科技部正式公布了2006年生命科学领域国家和部门重点实验室评估结果。依托于中国水稻研究所建设的水稻生物学国家重点实验室在此次评估中被评为优秀实验室，这是该实验室运行和建设取得的又一重大突破。

此次评估由科技部委托国家自然科学基金委员会组织，共有61个实验室参评，其中国家重点实验室47个，部门和地方重点实验室14个。评估结果仅有12个实验室获评优秀，其余49个为良好。由中国水稻研究所和浙江大学共同建设的水稻生物学国家重点实验室在评估中名列前茅，荣获优秀等级。

水稻是我国第一大粮食作物，我国在杂交水稻、超级稻育种等应用研究领域居世界领先地位。该实验室的前身是1993年由农业部命名的“农业部水稻生物学重点开放实验室”。实验室面向国家粮食安全的重大需求，以水稻资源学和分子育种为重点，围绕水稻遗传与种质创新、水稻发育生物学、水稻环境生物学和分子育种等方面开展应用基础研究，为稻作科技发展提供资源平台和技术理论支撑，已成为我国重要的水稻种质资源创新基地和水稻分子育种中心。

2003年，该实验室被批准建设为水稻生物学国家重点实验室，这是我国迄今为止唯一以单一作物为主要研究对象的国家级重点实验室，也是浙江省生命科学领域第一个国家重点实验室。实验室的建成对加强我国水稻生物学基础研究、保障粮食安全具有重要意义。2005年初，由中国水稻研究所和浙江大学共建的水稻生物学国家重点实验室正式挂牌。

近5年来，实验室承担了包括973、863在内的一批国家重大研究项目，具备较强的承担国家重大研究任务的能力，取得了一系列重要研究成果。代表性成果包括“印水型不育胞质的发掘和利用”、“超级稻的选育及高产生理基础研究”、“水稻种质资源的收集、评价和共享”等。实验室审定品种38个，在Nature、Plant Cell等国内外重要学术刊物上发表论文400余篇，其中SCI收录70余篇，出版专著多部，取得发明专利4项，获得国家科技进步一等奖1项、二等奖1项，作为主要合作者获得国家科技进步一等奖1项、国家自然科学二等奖1项。此外，实验室建立了我国最大的水稻种质资源库，保存了近7万份种质资源。

实验室高度重视国内外合作研究与交流，特别是与中国科学院遗传与发育生物学研究所的合作取得了丰硕成果，提升了我国作物分子生物学研究的国际地位，在重要农艺性状的基因定位和育种研究中发挥了重要作用。实验室队伍建设措施得力，3人获得国家杰出青年科学基金，形成了一支知识、年龄结构合理、充满活力的中青年研究队伍。实验室先后举办多次国际、国内重要学术会议，并设立多项开放研究课题，通过广泛合作与交流，显著提升了研究层次和水平。