新疆在生物技术领域取得显著进展，高产奶牛胚胎生产占全国总量的50%以上，并成功实施了对草原害鼠的免疫不育控制。随着自治区重点实验室自主研发活动的日益活跃，一大批科研成果涌现，使新疆的基础应用研究形成了独特的品牌。

目前，新疆已建立11个自治区重点实验室。新疆动物生物技术实验室在高产奶牛的连续超排、胚胎分割以及受体牛同期发情处理等关键技术上取得突破，年产胚胎达5万枚，占全国胚胎生产总量的50%以上。新疆包虫病基础医学重点实验室突出科研的“民族性和地区性特点”，研制出组合抗原包虫病快速诊断试剂盒，已在全疆和西北包虫病高发地区推广应用。

“十五”期间，新疆重点实验室共承担国家973计划、863计划、国家自然科学基金和自治区各类科技计划等项目350项，经费近1.3亿元。省部共建国家重点实验室培育基地——新疆生物资源基因工程实验室紧扣特色生物资源研究需求，开展创新性研究，利用从盐生植物中发现的抗盐碱基因，获得转基因抗盐碱水稻、油菜和速生杨，对解决新疆盐碱地利用、促进盐土农业发展具有重要应用前景。实验室还通过克隆草原兔尾鼠卵透明带基因，研制免疫不育疫苗，经实验动物注射后抗生育率达70%以上，成功实施了对草原害鼠的“计划生育”。

新疆重点实验室不仅在基础研究上取得突破，还研发出特色浓郁的本土产品，成为知名品牌。新疆维吾尔药实验室在发掘、整理、研究、开发维吾尔药及特色天然药物的基础上，重点在中药、维吾尔药制剂工艺、质量标准、药理药效方面建立新药开发平台，承担了自治区70%左右的中药和民族药新药研发工作，多年来取得国家各类药品批件50余项。自主研发的奥斯曼系列化妆品、阿娜尔妇洁液等产品，已成为基于维吾尔用药理论的知名品牌。