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细胞凋亡蛋白水解图谱绘成

2008-09-01 03:50 生物通 生物通 阅读 0
核心摘要: 美国斯克里普斯研究院的研究人员在《细胞》杂志上公布了全面的蛋白质组学研究平台,可直接观察蛋白水解全过程,并绘制了细胞凋亡诱导的蛋白水解事件图谱,包含91个caspase底物和170个新发现的分解蛋白,揭示了活性效应蛋白生成可能是凋亡级联的主要功能。

来自美国斯克里普斯研究院(The Scripps Research Institute, TSRI)Skaggs生物化学与化学生理学研究所的研究人员,在世界上率先开展了蛋白质活性表达谱(activity-based protein profiling, ABPP)的绘制工作。他们在最新一期的《细胞》(Cell)杂志上公布了一个全面的、有效的蛋白质组学研究平台,可以直接观察到蛋白水解的全部过程。研究人员利用这一技术,获得了由天然细胞凋亡途径诱导的蛋白质组范围内的蛋白水解事件图谱。

领导这一研究的是Skaggs生物化学与化学生理学研究所的Benjamin F. Cravatt,他曾获得2005年美国化学会国家奖,是一位著名的蛋白研究专家。其研究小组在世界上率先开展了蛋白质活性表达谱的绘制工作,这一工作的完成将对蛋白酶作用底物的寻找起到巨大的推动作用。

蛋白水解(Proteolysis)即蛋白质的肽键水解,是指蛋白质在酶等催化剂作用下水解,生成氨基酸的过程。这个过程对于蛋白质的激活(失活)、转移以及降解意义重大,是一个关键的调控过程。

目前,寻找能全面描述生物系统中蛋白水解途径的方法是一个研究热点。在这篇文章中,研究人员发展了一种有效全面的蛋白质组学研究平台,利用这一方法能直接地从全局上观察蛋白水解事件。并且,研究人员也利用这一技术获得了由天然细胞凋亡途径诱导的蛋白质组范围内的蛋白水解事件图谱。

这张图谱包含了91个caspase底物,170个之前未知的细胞凋亡过程中分解的蛋白。令人惊讶的是,蛋白水解蛋白中的大部分,尽管已经进行了分解,仍然存在一些离散的蛋白结构域,这说明活性效应蛋白的生成也许是凋亡蛋白水解级联(apoptotic proteolytic cascades)的一个主要功能。

(来源:生物通)

(《细胞》(Cell),Vol 134, 679-691,Melissa M. Dix,Benjamin F. Cravatt)

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