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曙光5000高性能计算集群助力青岛生物能源研究所科研平台建设

2008-12-26 11:13 bioguider编辑部 青岛生物能源与过程研究所、曙光公司 阅读 0
核心摘要: 曙光公司曙光5000高性能计算集群成功中标青岛生物能源与过程研究所,为生物能源领域提供强大的生物信息分析、模拟与存储能力。该平台将推动基因组、蛋白质组等高通量数据处理,助力我国生物能源产业规模化发展与技术创新。

近日,曙光公司以曙光5000为核心的高性能计算集群解决方案成功中标中国科学院青岛生物能源与过程研究所高性能计算平台项目。该平台专为生物计算设计,能够支持多种生物领域应用软件,满足基因组、转录组、蛋白质组、代谢物组等生物信息的高通量获取、处理、存储、注释、模拟和分析需求。

曙光公司针对实际应用需求,采用曙光5000为集群计算核心,曙光A950r-F作为胖节点,曙光A620r-FX作为IO及管理节点,HDS WMS100作为主要存储单位,构建了全面的高性能计算与存储解决方案。系统配置38个曙光5000计算刀片,共304个CPU核心,峰值计算性能达2.5536万亿次。节点间采用10Gb速率Infiniband互连,保障通信密集型和IO密集型并行应用的网络性能。高性能SAN存储系统满足大规模生物数据的IO需求,配备SKVM系统、集群管理软件及作业调度系统,实现高效整合与管理。

青岛生物能源与过程研究所作为国家战略需求下新成立的科研单位,重点研究生物能源。生物能源研究高度依赖现代高性能计算平台和大容量存储系统。该集群系统不仅用于生物信息分析,还支持代谢工程中代谢通量和细胞活动的模拟、酶工程中蛋白质结构及分子相互作用解析、复杂工程反应过程与反应器设计模拟,以及院所信息化系统建设(ARP系统、WEB应用、数据库应用、备份和网络安全保障)。

生物能源作为新兴科研领域,依赖高性能计算推动理论、实验与模拟的融合。随着石油等化石能源日益紧缺,生物能源技术成为替代石油的重要途径,包括谷物、秸秆等生物质发酵生产乙醇、车用油及化工原材料,以及利用劣质食用油、麻疯树籽等直接加工高品质柴油。我国在生物质能加工转化及相关环保技术领域积累丰富,具备实现生物能源和生物材料产业规模化的条件,有望在2020年形成万亿元产值,部分替代石油,保障国家能源安全。

高性能计算集群的引入,将极大提升我国生物能源研究与产业化进程的技术支撑能力。

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