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碧蛾蜡蝉线粒体基因组全序列首次测定

2009-04-21 11:40 梁爱萍研究组 中国科学院动物研究所 阅读 0
核心摘要: 中国科学院动物研究所梁爱萍研究组首次测定了碧蛾蜡蝉(Geisha distinctissima)的线粒体基因组全序列,该基因组为15,971 bp的闭合环状分子,A+T含量达75.1%,基因内容与果蝇相似。研究填补了蜡蝉总科线粒体基因组数据的空白,为半翅目系统发育研究提供了重要依据。

自1758年林奈建立半翅目以来,该目高级阶元间的系统发育关系一直存在争议。蜡蝉总科被认为是决定半翅目系统发育关系的关键分类单元。目前,GenBank中已收录许多半翅目昆虫的线粒体基因组全序列或接近全序列,但尚无蜡蝉总科昆虫的线粒体基因组全序列报道。因此,测定蜡蝉总科昆虫的线粒体基因组全序列对半翅目系统发育研究具有重要意义。

中国科学院动物研究所梁爱萍研究组首次获得了蜡蝉总科昆虫——碧蛾蜡蝉(Geisha distinctissima,半翅目:蛾蜡蝉科)的线粒体基因组全序列。结果显示:碧蛾蜡蝉线粒体基因组为15,971 bp的闭合环状分子,整个基因组的A+T含量为75.1%,其基因内容、顺序和结构均与果蝇(Drosophila yakuba)相同。所有13个蛋白质编码基因均以ATR或ATT作为起始密码子;9个基因以典型的TAA或TAG为终止密码子,其余4个基因(cox1、atp6、cox3和nad4)使用不完全终止密码子T。所有转运RNA(tRNA)的反密码子均与果蝇或长沫蝉(Philaenus spumarius)相同;除tRNASer(AGN)外,其余tRNA均能形成典型的三叶草结构。主要非编码区(A+T富含区或控制区)位于小核糖体亚基和tRNAIle之间,由两组重复区域构成:第一组位于srRNA端,由4个完全相同的152 bp重复单元组成;第二组位于tRNAIle附近,由多个19 bp重复单元组成。与其他半翅目昆虫线粒体基因组相比,碧蛾蜡蝉的线粒体基因组具有相似的基因内容和排序。相关研究成果发表于《ACTA BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA SINICA》。

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