2005年7月1日，美国《科学》杂志第309卷第5731期出版。本期专题为“125个大的科学问题”，以庆祝《科学》创刊125周年。专题探讨了宇宙构成、意识生物学基础、人口与消费可持续性等关键问题。编辑团队从100多个候选题目中精选出125个问题，其中25个被认为在未来25年内有望解决或取得突破。专题介绍由主编Donald Kennedy和Colin Norman撰写，题为《我们不知道什么？》。

纳米技术在发展中国家：纳米技术被视为变革性技术，可能缩小南北差距。Mohammed Hassan建议在撒哈拉以南非洲等地建立纳米技术卓越中心，促进合作，并投资解决饮用水、可再生能源和HIV/AIDS等问题的研究。

纳米科学在中国：白春礼指出，中国纳米科学始于20世纪80年代，现已成为全球领先力量。中国科学家在碳纳米管纺线等领域取得重要进展，有望制造防弹或抗电磁波材料。白春礼预测中国将在纳米时代发挥关键影响力。

给单个分子连导线：Lidong Qin等人开发了“线上蚀刻”技术，可制造纳米导线并连接单个分子，为纳米电子器件奠定基础。Charles Martin和Lane Baker在评述中强调下一步需制造小于5纳米的空隙并插入单个分子。

对付B族链球菌的通用疫苗：Domenico Maione等人通过多基因组分析，发现四种蛋白组合能诱导小鼠产生广泛保护力，有望开发出针对B族链球菌的通用疫苗。该菌是新生儿致命感染的主要病因，现有疫苗仅针对发达国家常见菌株。

正确指示药物靶标：Jaejoon Won等人开发了“MAGIC”技术，利用超顺磁纳米粒子标记药物分子，在活细胞中通过磁场富集靶标蛋白，从而准确识别药物作用靶点。该技术有助于理解药物疗效和副作用，并用于高通量筛选。