2005年国家高技术研究发展计划（863计划）第三、四批立项课题涵盖了生物技术、农业、医学等多个前沿领域，以下为部分代表性课题及其研究内容：
治疗性克隆及其在帕金森病和肌萎缩侧索硬化症中的应用研究（课题编号：2005AA219010，承担单位：中国人民解放军军事医学科学院野战输血研究所，负责人：裴雪涛）。该课题旨在探索利用治疗性克隆技术获取胚胎干细胞，并诱导分化为多巴胺能神经元或运动神经元，为帕金森病和ALS提供细胞替代治疗策略。
纳米生物骨修复活性材料的研制（课题编号：2005AA219020，承担单位：卫生部肝胆肠外科研究中心，负责人：张阳德）。研究聚焦于开发具有生物活性的纳米复合材料，用于骨缺损修复，通过模拟天然骨基质结构促进骨再生。
高直链淀粉玉米的分子设计及选育（课题编号：2005AA219030，承担单位：北京师范大学，负责人：王英典）。利用分子标记辅助选择和基因工程手段，培育高直链淀粉含量的玉米品种，以满足工业原料需求。
重金属污染的生物修复（课题编号：2005AA219040，承担单位：湖南科技大学，负责人：冯涛）。研究利用微生物或植物对重金属污染土壤和水体进行修复，筛选高效修复菌株或超积累植物。
动物胚胎干细胞建系及诱导分化（课题编号：2005AA219050，承担单位：西北农林科技大学，负责人：窦忠英）。建立多种动物胚胎干细胞系，并探索向特定细胞类型（如心肌细胞、神经细胞）的定向分化条件。
基于酵母展示的脂肪酶定向进化与发酵耦联化应用研究（课题编号：2005AA219060，承担单位：华南理工大学，负责人：林影）。通过酵母表面展示技术对脂肪酶进行定向进化，提高其催化效率，并实现发酵与酶催化耦联。
新发传染性疾病病原检测及分子流行病学研究（课题编号：2005AA219070，承担单位：中国科学院武汉病毒研究所，负责人：袁志明）。建立快速检测新发传染病病原体的方法，并开展分子流行病学调查，为疫情防控提供技术支持。
优质、高产、抗逆农作物新品种选育与繁育技术研究（课题编号：2005AA207010，承担单位：中国水稻研究所，负责人：程式华）。综合运用常规育种与分子育种技术，培育兼具优质、高产和抗逆性的水稻新品种。
RNA在PCG介导的表现基因沉默中的作用研究（课题编号：2005AA210910，承担单位：北京生命科学研究所，负责人：张宏）。研究非编码RNA如何参与Polycomb group蛋白介导的基因沉默，揭示表观遗传调控机制。
小核仁核酸蛋白复合物的结构和功能（课题编号：2005AA210920，承担单位：北京生命科学研究所，负责人：叶克穷）。解析小核仁核糖核蛋白复合物的三维结构，阐明其在rRNA加工修饰中的功能。
哺乳动物体细胞克隆胚胎再编程机理与核移植胚胎干细胞的研究（课题编号：2005AA210930，承担单位：北京生命科学研究所，负责人：高绍荣）。研究体细胞核移植后胚胎重编程的分子机制，并建立核移植胚胎干细胞系。
TGA转录因子调控系统获得性抗性的机理研究（课题编号：2005AA210940，承担单位：北京生命科学研究所，负责人：张跃林）。研究TGA转录因子在植物系统获得性抗性中的调控网络，揭示其与病程相关基因表达的关联。
非典型肺炎型军团菌感染宿主细胞的生物化学机理研究（课题编号：2005AA210950，承担单位：北京生命科学研究所，负责人：邵峰）。探究军团菌效应蛋白如何调控宿主细胞信号通路，为抗感染药物开发提供靶点。
嗅觉及社会信号的神经编码及调控社会行为的神经生理机制（课题编号：2005AA210960，承担单位：北京生命科学研究所，负责人：罗敏敏）。利用电生理和成像技术，解析嗅觉系统如何编码社会信号并调控社会行为。