马大龙，现任北京大学人类疾病基因研究中心主任、北京大学医学部免疫学系教授，曾任第一、二届科技型中小企业技术创新基金专家咨询委员会副主任委员。他回顾了创新基金自1999年成立以来的发展历程，强调其在推动技术创新和科技型中小企业发展中的关键作用。

马大龙指出，创新基金在运作机制上大胆探索，设立了专家咨询委员会，实行决策权与审批权分离，确保项目评审的公开、公平、公正。基金还率先建立了电子信息管理系统，实现全程网上申报，提高了管理效率和透明度。此外，创新基金引入中介机构参与立项审查和结题评估，强化了后期管理，并鼓励地方政府设立配套基金，形成上下联动的支持体系。

数据显示，2008年创新基金规模达14亿元，立项2470项。截至2008年，累计投入中央财政76.5亿元，资助14450个项目，支持12000家中小企业，验收合格率达82.3%。马大龙建议，应进一步加大创新基金支持力度，鼓励民间资本和风险基金进入，探索资本金投入方式，并加强与其他科技计划的整合，使创新基金成为建设创新型国家的中坚力量。