当前位置: 主页 > 生物技术 > 实验技术与方法

实验室常用技术参数资料

2006-02-23 15:06 未知 未知 阅读 0
核心摘要: 本文汇总了分子生物学和生物化学实验中常用的技术参数,包括核酸与蛋白质的物理常数、缓冲液配制方法、酶溶液、抗生素、凝胶技术等,为实验室操作提供参考。内容涵盖核苷三磷酸的摩尔消光系数、核酸分子量换算、常用缓冲液pH配制、蛋白水解酶使用、抗生素工作浓度、贮存液配制步骤及凝胶技术参数,是实验室日常工作的实用手册。

本文汇总了分子生物学和生物化学实验中常用的技术参数,包括核酸与蛋白质的物理常数、缓冲液配制、酶溶液、抗生素、凝胶技术等,为实验室操作提供参考。

一、核酸及蛋白质常用数据

1. 核苷三磷酸的物理常数

核苷三磷酸(NTP)和脱氧核苷三磷酸(dNTP)在pH 7.0下的最大吸收波长(λmax)和摩尔消光系数是定量分析的基础。例如,ATP在259 nm处的摩尔消光系数为15400 L/(mol·cm),OD280/OD260比值为0.15。这些数据用于计算核酸浓度。

2. 常用核酸的长度与分子量

λDNA(48502 bp)分子量约3.0×10^7 Da,pBR322质粒(4363 bp)约2.8×10^6 Da。rRNA和tRNA的分子量也列出,用于凝胶电泳标记。

3. 常用核酸蛋白换算数据

1 A260双链DNA = 50 μg/ml,1 A260单链RNA = 40 μg/ml。DNA摩尔换算:1 μg 100 bp DNA = 1.52 pmol。蛋白质/DNA换算:1 kb DNA编码333个氨基酸,对应约3.7×10^4 Da蛋白质。

4. 常用蛋白质分子量标准参照物

高分子量标准包括肌球蛋白(212 kDa)、β-半乳糖苷酶(116 kDa)等;中分子量包括磷酸化酶B(97.4 kDa)、牛血清白蛋白(66.2 kDa)等;低分子量包括碳酸酐酶(31 kDa)、溶菌酶(14.4 kDa)等。

5. 常用DNA分子量标准参照物

λDNA/HindIII、λDNA/EcoRI、pBR322/HaeIII等酶切片段大小列表,用于琼脂糖凝胶电泳分子量标记。

二、常用缓冲液

1. 分子克隆常用缓冲液

包括Tris-乙酸(TAE)、Tris-磷酸(TPE)、Tris-硼酸(TBE)等电泳缓冲液,以及SDS凝胶加样缓冲液。TBE长时间存放易沉淀,建议室温保存5×贮存液。

2. 磷酸缓冲液

0.1 mol/L磷酸钾缓冲液(pH 5.8-8.0)和磷酸钠缓冲液(pH 5.8-8.0)的配制方法,基于Henderson-Hasselbalch方程计算pH。

3. 电泳缓冲液

测序凝胶加样缓冲液含98%去离子甲酰胺、10 mmol/L EDTA、0.025%二甲苯青FF和溴酚蓝。甲酰胺需去离子处理。

4. 凝胶加样缓冲液

6×缓冲液类型包括溴酚蓝/二甲苯青FF/蔗糖、聚蔗糖、甘油等。溴酚蓝在琼脂糖中迁移速率相当于300 bp DNA,二甲苯青FF相当于4 kb DNA。

5. 各种pH值的Tris缓冲液的配制

0.05 mol/L Tris-HCl缓冲液(pH 7.1-8.9)的配制,以及温度对pH的影响(4℃、25℃、37℃)。常用缓冲液pKa值:Tris 8.08,HEPES 7.47,MOPS 7.15,PIPES 6.76,MES 6.09。

6. 温度对常用缓冲液pH的影响

列出Mes、Ada、PIPES等缓冲液的pKa(20℃)和ΔpKa/10℃。

三、常用酶的配制

1. 溶菌酶:50 mg/ml水溶液,-20℃保存。

2. 蛋白水解酶类:链霉蛋白酶(20 mg/ml,-20℃)需自消化去除核酸酶;蛋白酶K(20 mg/ml,-20℃)在含EDTA缓冲液中活性稳定,但消化角蛋白需加Ca²⁺。

3. 无DNA酶的RNA酶:胰RNA酶A(10 mg/ml)在100℃加热15 min灭活DNA酶,-20℃保存。

四、常用抗生素溶液

氨苄青霉素(50 mg/ml,水溶,-20℃),工作浓度20-60 μg/ml;氯霉素(34 mg/ml,乙醇溶,-20℃),工作浓度25-170 μg/ml;四环素(5 mg/ml,乙醇溶,-20℃),工作浓度10-50 μg/ml,注意镁离子拮抗。

五、常用贮存液的配制

包括30%丙烯酰胺(29:1,神经毒性,需戴手套)、40%丙烯酰胺(DNA测序用)、放线菌素D(致畸,避光)、ATP(0.1 mol/L,pH 7.0)、过硫酸铵(10%,4℃保存数周)、BCIP(0.5 g/10 ml DMF)、BES缓冲盐(2×,pH 6.96)、CaCl₂(1 mol/L,用于感受态细胞)、DTT(1 mol/L,不能高压)、dNTP(50 mmol/L,-70℃)、EDTA(0.5 mol/L,pH 8.0)、溴化乙锭(10 mg/ml,强诱变剂)、HEPES缓冲盐(2×,pH 7.05)、IPTG(0.2 g/ml,-20℃)、乙酸镁(1 mol/L)、MgCl₂(1 mol/L,易潮解)、β-巯基乙醇(14.4 mol/L,不能高压)、NBT(0.5 g/10 ml 70% DMF)、酚/氯仿(等体积混合,腐蚀性)、PMSF(10 mmol/L,异丙醇溶,剧毒,水溶液不稳定)、PBS(pH 7.4,高压灭菌)、乙酸钾(1 mol/L,pH 7.5)、乙酸钾(碱裂解用,3 mol/L K⁺,5 mol/L Ac⁻)、乙酸钠(3 mol/L,pH 5.2或7.0)、NaCl(5 mol/L)、SDS(10%,pH 7.2,微细晶粒易扩散)、SSC(20×,pH 7.0)、SSPE(20×,pH 7.4)、三氯乙酸(100%)、Tris(1 mol/L,pH 7.4-8.0,温度影响pH)、TBS(25 mmol/L Tris,pH 7.4)、X-gal(20 mg/ml,DMF溶,避光)。

杂交试验中用于降低背景的封闭剂

Denhardt试剂(50×,含聚蔗糖、PVP、BSA),用于Northern和Southern杂交;BLOTTO(5%脱脂奶粉,含叠氮钠,不能用于Northern杂交);肝素(50 mg/ml,4℃保存);鲑精DNA(10 mg/ml,剪切变性后使用)。

六、常用凝胶的技术参数

1. 葡聚糖凝胶的某些技术数据

Sephadex G-10至G-50的颗粒直径、分子量分级范围、床体积、得水值、平衡时间和柱头压力。例如,G-25粗级(100-300 μm)分级范围1000-5000 Da,床体积4-6 ml/g干胶。

    发表评论