2010年2月3日，中国科学院昆明植物研究所宣布，在吴征镒、周俊、孙汉董三位院士的推动下，世界首个茶树基因组测序计划在昆明正式启动。该项目旨在对云南大叶茶进行全基因组测序，揭示其遗传密码，为普洱茶产业和茶树育种提供科学基础。

茶树基因组测序是继人类、水稻、血吸虫、家蚕、黄瓜、大熊猫等基因组计划后，我国科学家独立启动的首个树木全基因组测序项目，也是当时世界上最大的树木基因组测序项目。项目首席科学家高立志研究员指出，通过测序和组学研究，可以解析茶树农艺性状的基因组学基础，鉴别与次生代谢成分相关的功能基因，研究其生物合成途径，从而构建分子育种平台，培育优质高产、生态适应性强的茶树品种。

该项目依托中国西南野生生物种质资源库和中国科学院超算中心西南分中心，由世界一流的科学家团队执行。预计2010年6月完成主体测序，2011年3月获得基因组草图，2012年底完成精细图谱。测序成果还将推动云南木本油料资源和山茶花产业的革命性发展。