近年来，中国研究经费持续以20%的比例增长，但这种增长并未对科学和研究起到应有的强大促进作用。清华大学生命科学学院院长施一公教授与北京大学生命科学学院院长饶毅教授近日联合撰文，质疑国内科研基金分配体制，认为研究基金必须基于学术优劣来分配，而非依赖私人关系。
饶毅与施一公分别于2007年和2008年全职回国，此前他们分别是美国西北大学和普林斯顿大学的讲席教授。他们在文章中指出，尽管研究经费大幅增长，但分配问题滞缓了潜在创新步伐。对于国家自然科学基金委资助的小型项目，科学优劣仍是关键；但对于政府各部门的巨型项目，科学优劣的相关性较小。专家委员会由官员任命，其意见往往反映少数官员与科学家之间的相互理解，甚至经费预定给谁一目了然。
科技管理过度行政化、科技活动过度利益化是院士群体反映最多的问题。中科院报告《中国科技体制与政策》显示，近六成被调查科技工作者反映利益因素阻碍合作，科技立项中存在权力寻租和利益交易。各级行政管理人员对科技立项有实质性决定权，科技评价缺乏真正的学术评价，专家评审机制流于形式。