来自耶鲁大学等机构的研究人员对两种重要的模式生物——秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）和黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）进行了系统分析，获得了详细的基因表达数据。该研究属于modENCODE计划，成果发表于《科学》（Science）杂志。

modENCODE计划背景：2003年，美国启动了ENCODE计划（DNA元件百科全书），旨在建立人类基因组中功能性元件的完整目录。2007年，美国国家人类基因组研究所（NHGRI）拨款5700万美元，启动了modENCODE计划（模式生物ENCODE项目），以补充ENCODE计划在模式生物中的研究。

ENCODE计划的目标包括整合物种描述、图片、分布地图、视频、声音以及基因组和科学论文链接等。尽管基因组测序已深入，但基因组如何指导细胞生长和组织发育的机制仍不明确，modENCODE计划旨在填补这一空白。

最新研究成果：研究人员收集了线虫整个发育过程中237个与基因结构、RNA表达及染色质调节相关的数据集，并进行分析，构建了更完整、精确的基因转录和表达模型。同时，分析了超过700个果蝇基因表达数据库，揭示了基因与机体功能之间的联系。这些结果有助于更精确地预测基因功能、组织发育调节因子及基因表达水平。

两项研究首次发现了线虫和果蝇基因组中的高占据靶标（HOT）区域，这些区域结合了超过15种不同的转录因子。这些发现不仅提供了两种关键模式生物的功能信息，也有助于解决人类相关疾病问题。