据2006年4月16日报道，尽管干细胞研究在科学上具有巨大潜力，但全球范围内该领域的资金投入严重不足，尤其是风险投资态度谨慎。在生物技术行业组织年会上，众多生物技术高管探讨了如何改变这一现状。

虽然政府对干细胞研究表现出兴趣并投入资金，例如美国加利福尼亚州通过71号提案拨款30亿美元，但风险资本公司仍持观望态度。Charter生命科学风险投资公司总经理弗雷德·施瓦兹尔指出，2005年生物技术与医疗设施总投资59亿美元中，干细胞研究仅占1.2亿美元。原因包括科学不确定性、产权问题以及缺乏明确的收益模式。

干细胞具有分化为多种细胞类型的潜力，可用于修复损伤组织，但面临诸多挑战。原美国国立健康研究院干细胞部门主管马恩德拉·劳指出，移植细胞存在癌变风险。英国“干细胞科学”公司总经理彼得·蒙特佛德提到，免疫排斥反应也是难题，例如帕金森病或糖尿病患者的细胞移植可能被免疫系统攻击。

此外，胚胎干细胞研究涉及伦理争议，因为需要破坏胚胎。布什总统因此限制了联邦经费，而加州71号提案也因法律诉讼被搁置。施瓦兹尔表示，风险投资公司虽关注干细胞，但更倾向于等待研究成熟后再介入。

蒙特佛德预测，人类胚胎干细胞研究可能需要5到10年才能取得良好临床试验结果。商业化模式也是问题：干细胞疗法不同于传统药物，需要细胞移植和手术，投资者难以评估收益。施瓦兹尔认为，一旦公司解决首次公开募股（IPO）问题，私人投资将跟进。

在日本，私人投资已开始进入干细胞产业，但北美投资环境与美国类似。加拿大“干细胞疗法”公司法律顾问克雷格·谢尔邦尼表示，阿尔伯塔资金匮乏，该公司通过IPO筹集850万美元，并寻求与药企合作。施瓦兹尔提醒，其公司已向干细胞研究投资1.2亿美元，并密切关注该领域。