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标签主题:进化基因组学

学术索引

通过检验树的拓扑结构策略检测新近发生的正选择

本文研究了通过检验树的拓扑结构策略来检测新近发生的正选择,实现了20年来理论群体遗传学的一个梦想。该方法不受群体历史数量变动的影响,仅需来自100至1000 bp范围内的遗传多态数据即可可靠地检测新近发生的正选择。...

2010-08-24 29 0

金小蜂如何构建复杂的抗微生物免疫系统

中科院动物研究所朱顺义团队利用进化基因组学方法,从丽蝇蛹集金小蜂基因组中鉴定出44个抗微生物肽新基因,构建了首个寄生性昆虫抗微生物肽基因蓝图。研究发现基因重复和正选择驱动了防御肽的适应性进化,并与意大利蜜蜂比较揭示了基因扩张和结构多样性是免疫复杂度增加的主因。该研究为寄生性昆虫免疫机制及人类抗微生物肽发现提供了基础。...

2010-05-27 11 0

张亚平院士发表国际著名刊物文章 解析关键基因

中国科学院昆明动物研究所张亚平院士和施鹏研究员团队在《Genome Biology and Evolution》发表研究,通过进化基因组学方法系统分析信息素受体V1R基因家族。研究发现该基因家族是哺乳动物中基因数目差异倍数最大的家族,并揭示穴居和夜行哺乳动物趋向拥有更多V1R基因,提示快速基因产生和氨基酸替代加速可能为对狭窄环境和夜行生活的适应。该成果为理解环境因子与感觉系统分子进化提供了重要指示。...

2010-05-20 23 0

蕨类植物桫椤叶绿体基因组学研究进展

中国科学院武汉植物园成功测定了孑遗蕨类植物桫椤的叶绿体基因组全序列,并进行了进化基因组学分析。研究发现桫椤叶绿体基因组全长156,661碱基对,编码117个基因,其中trnR-UCG基因可能为树蕨类独有特征。研究还鉴定出蕨类植物经历的新倒位及一段含11个串联重复的特殊区域。该成果为叶绿体基因组结构和蕨类植物系统发育研究提供了重要基础。...

2009-07-25 64 0

NHGRI将测序8种新的哺乳动物序列

NHGRI启动三大优先测序计划,重点分析48个人类DNA样本中的结构变异,扩展恒河猴、狨猴及猩猩的高密度基因组测序,并对8种新哺乳动物进行低密度测序。物种选择基于样本质量、生物医药模型潜力及进化相关新生物过程,旨在深化对哺乳动物基因组结构变异及其进化机制的理解。测序由五大研究中心协同完成,推动基因组学与生物医学研究融合。...

2006-03-19 591 0

JGI科学家完成第一种甲壳类动物鸟枪法测序

联合基因组研究院完成了水蚤Daphnia pulex的首个甲壳类动物鸟枪法全基因组测序,获得包含12条染色体、约2亿碱基对的高质量序列数据。该测序采用随机片段化与计算机组装策略,确保序列准确性,数据公开后将促进环境遗传学及昆虫进化路径研究,揭示陆地生态系统演变的遗传基础。...

2006-01-25 533 0
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