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加拿大团队利用PacBio技术破译“筑坝高手”海狸的基因组

加拿大团队利用PacBio技术破译“筑坝高手”海狸的基因组

加拿大团队利用PacBio单分子测序技术成功破译了加拿大海狸的基因组,组装了27亿个碱基的序列,并注释了重复序列和蛋白编码区。该研究为海狸的进化历史和生态影响提供了重要基因组学资源,同时展示了PacBio与Illumina测序技术的结合应用。...

2017-01-18 141 0

单分子测序改善微生物基因组组装

美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员在《Genome Biology》上发表文章,介绍单分子实时(SMRT)测序技术在微生物基因组组装中的应用。研究表明,利用单个PacBio RS测序文库,大部分已知细菌和古细菌基因组能被完整组装,成本低于1000美元。该技术有望改善微生物基因组数据库质量,推动群体规模泛基因组研究。...

2013-09-26 138 0

2013年新一代测序仪技术进展综述

2013年,新一代测序技术快速发展,Illumina推出HiSeq 2500并计划实现10 kb长读取;罗氏454 GS FLX+系统读长超1 kb;PacBio RS系统平均读长达5 kb;Life Technologies推出Ion Proton测序仪及自动化样品制备系统。各厂商在读长、通量和准确性上不断突破,推动测序技术向临床应用迈进。...

2013-02-17 124 0

单分子测序轻松升级参考基因组

现代基因组学追求高质量完整基因组,但二代测序读长短导致大量缺口。美国贝勒医学院Richard Gibbs团队利用PacBio单分子测序长读长优势,结合自研PBJelly工具,对果蝇、虎皮鹦鹉和黑子白眉猴基因组进行升级,大幅减少缺口数(最高15倍)和缺口大小(3-6倍),验证了方法的可靠性。该技术无需PCR,能轻松跨越重复和高GC区域,低深度测序即可改善大型脊椎动物基因组完整性,为基因组组装提供了高效解决方案。...

2012-09-11 169 0
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