1月17日，基因组生物技术公司10x Genomics宣布，一项使用其Chromium Single Cell 3'平台的研究成果在《自然》子刊《Nature Communications》上发表。该研究由Fred Hutchinson癌症研究中心的研究人员合作完成，利用强大的基因组测序技术获得了大批高质量单细胞表达测量数据，有助于揭示基因表达动力学和单个细胞类型的分子谱系。研究论文题为“单细胞的大规模并行数字转录谱分析”。

“早期的单细胞RNA测序方法对许多实验室来说具有挑战性，包括我们自己。因此，我们与10x Genomics公司合作，帮助验证和定制其单细胞RNA测序平台，拓展单细胞转录组学在生物学基础研究和临床研究中的潜力，”该研究的通讯作者、Fred Hutchinson癌症研究中心的Jason Bielas博士说道：“10x Genomics单细胞分析的速度、可重复性和高细胞捕获效率使我们能够准确地分析从那些经历过多轮化疗、移植调节和免疫抑制的急性骨髓性白血病患者中分离的脆性骨髓样品。”

现有的单细胞RNA测序方法在扩展到数万或更多细胞的通量时面临实际挑战。10x Genomics通过提供创新的基因组平台，结合新的微流体科学、化学和生物信息学，显著提升了测序能力。传统的基于实验平板的方法需要耗时的荧光激活细胞分选（FACS）和单独处理多个平板；基于微流体的平台利用机械捕获细胞，但通量和捕获效率受限；学术界的基于液滴的技术虽能处理数万个细胞，但难以有效实施或扩展。而Chromium Single Cell 3'解决方案在单次测定中解决了这些缺点，具有高细胞捕获效率和灵活的通量，为单细胞RNA测序提供了更可扩展、更强大的平台。

为了演示Chromium Single Cell 3'平台的技术性能和应用，研究人员从29个样本中收集了约25万个单细胞的转录组数据。结果显示，该系统对单细胞RNA测序具有优越的可扩展性和高质量，灵敏度与现有方法相当。其快速的细胞封装和高捕获效率使得能够分析来自急性骨髓性白血病患者的珍贵临床样品。利用该平台，研究人员在单细胞分辨率下确定了宿主和供体嵌合现象，并比较了移植前后患者的免疫细胞亚群变化。

10x Genomics的联合创始人兼首席执行官Serge Saxonov博士表示：“当我们了解到Bielas博士及其团队在使用10x平台时取得的成功，我们感到非常激动。这项发表的研究验证了我们的系统，并突出了从快速、可扩展的单细胞分析中可以获得的新见解。我们期待更多这类研究及其对各种临床应用的潜在影响。”