我国首次发表中国猕猴全基因组序列多态数据
时间:2011-07-21 00:00 来源:深圳特区报 作者:谭大跃、黄春艳 点击:次
近日,我国科学家在基因组学知名期刊《Genome Biology》上首次发表了中国猕猴全基因组序列多态数据。猕猴作为人类的近亲,是生物医学研究中最广泛使用的非人灵长类模式动物,但其基因组序列多态性此前了解甚少。 中国科学院昆明动物研究所与深圳华大基因研究院合作,采用二代测序技术对中国猕猴进行了全基因组测序,测序深度达到猕猴基因组的11.56倍覆盖率。通过与已发表的印度猕猴基因组序列比较,研究团队共发现550万个单核苷酸多态性位点(SNP),其中294万个为中国猕猴基因组中的杂合多态性位点,256万个为中国猕猴与印度猕猴间的差异位点。此外,还鉴定出超过12万个基因组结构变异。 这是首次对猕猴全基因组序列多态性的系统解析,所报道的海量多态数据为以猕猴为对象的生物学和临床前医学研究提供了重要基础数据。研究还建立了中国猕猴全基因组序列多态性数据库(CMSNP),为后续数据分析提供了可视化平台。 华大基因项目负责人方晓东表示,猕猴生理上与人类高度相似,是生物学、心理学、医学等领域的理想实验动物。该研究不仅有助于理解灵长类进化过程,也为人类疾病模型构建和药物研发提供了关键遗传资源。 (责任编辑:glia) |
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