在第三届中外大学校长论坛上，多位大学校长呼吁改革现行科研经费管理制度，指出相当一部分科研项目已成为某些科研人员和机构的“圈钱项目”。

大学和科研机构通过课题、项目获取科研经费的比重日益增大。2004年，中央所属高校科研经费拨款占经费收入的比重已超过8%，重点大学增长更快。公立科研院所经费主要依赖政府课题，自2001年起推行课题制管理，以课题为中心，课题责任人全权负责，经费自主核算。这种模式激发了科研竞争和积极性，但同时也导致部分经费未用于科研，被变相转为私有财产。

此外，部分知名教师和科研人员成为“科研商人”，精力集中于拉经费，而非科研本身。他们通过高额提成获得较高收入，造成内部收入不均，污染了公平竞争和创新的精神空气，对知识创新和科技发展的负面影响远超资金浪费。

科技部拟筹建科技经费监管中心，加强项目经费监管，建立绩效评价制度。然而，自上而下的监管效果存疑，现有规则体系虽严密，但未能有效发挥作用。因此，需重新思考科研人员依赖课题经费维持生活的合理性。政府最初通过项目拨款变通增加科研人员收入，但解决了部分问题，也带来了新问题。

诺贝尔经济学奖得主哈耶克指出，知识进步常发生于未知领域，科研人员对兴趣的追求或偶然因素往往推动重大发现。项目课题制度仅在具体技术领域有促进作用，难以预知科学发展方向。因此，应改革大学和公立科研机构的收入制度，提高名义工资，缩小项目拨款范围与数量，为科研人员创造稳定环境，使其潜心探索。在此基础上，监管才能奏效。