APOB基因XbaI多态性是一种与脂质代谢相关的遗传变异,其检测对于研究心血管疾病具有重要意义。本文介绍了一种基于PCR技术的APOB基因XbaI多态性检测方法。
实验流程
1. **模板准备**:使用100-200 ng基因组DNA作为模板,反应体系体积为25 μl。
2. **引物设计**: Primer 1 (APOBXB1): 5'-AAA TAA CCT TAA TCA TCA ATT GGT 3' (100 ng/反应) Primer 2 (APOBXB2): 5'-GGT TCT TAG CAG CAA GAG TCC 3' (100 ng/反应)
3. **反应体系**: - dNTPs:最终浓度200 μM - 缓冲液:最终浓度2.25 mM MgCl2, 50 mM KCl, 10 mM Tris-HCl (pH 8.4) - Taq DNA聚合酶:0.5 U/反应 (Perkin-Elmer Amplitaq DNA聚合酶,5 U/μl,Cat. No. N808-0145)
4. **PCR循环条件**: 95°C 5分钟 95°C 30秒,60°C 30秒,72°C 30秒,30个循环
5. **产物分析**: XbaI酶切位点多态性导致PCR产物大小差异: - 野生型:230 bp - 杂合子:230 bp, 160 bp和70 bp
参考文献 Boerwinkle, E., S.S.Lee, R. Butler, VN Schumaker, and L. Chan, 1990. Rapid typing of apolipoprotein B DNA polymorphisms by DNA amplification. Atherosclerosis 81:225-232.