线粒体DNA分离是一种用于分离和纯化线粒体DNA的实验技术。以下是实验步骤:
1. 将组织样本在研钵或Waring搅拌机中与5-7倍体积的缓冲液A混合,使用MCE浓度为350 l/L,如果必要,可以添加5 ml 1 M DIECA/L。
2. 将混合物过滤通过纱布和两层Miracloth。
3. 离心10分钟,1000 g,弃去上清液,继续离心10分钟,15900 g。
4. 将每个沉淀物在少量缓冲液G中重新悬浮,合并,调整至约10 ml/50 g或15 ml/75 g。
5. 离心10分钟,1000 g,弃去大部分上清液,轻轻摇晃沉淀物以去除松散层,合并上清液。
6. 将上清液中的MgCl2浓度调整至10 mM(100 l 1M/10 ml),添加DNase至20 g/ml(100 l 2mg/ml/10 ml)。
7. 在4°C下孵育60分钟。
8. 在底层缓冲液中添加20 ml/10-15 ml,总是使用20 ml或以上的体积。
9. 离心20分钟,12000 g,重新悬浮沉淀物在少量底层缓冲液中,调整至约10 ml/50-100 g。
10. 离心10分钟,15900 g,重新悬浮沉淀物在NN(裂解)缓冲液中(4-5 ml/50-75 g)。
11. 添加SDS至0.5%(250 l 10%/5 ml NN),充分混合。
12. 添加蛋白酶K至100 g/ml(25 l 20 mg/ml/5 ml NN),轻轻混合。
13. 在37°C下孵育60分钟。
14. 添加等体积的3:1水饱和酚,氯仿-异戊醇混合物,乳化约5分钟。
15. 离心10分钟,7000 g,收集上清液,重复步骤14和15,总共进行3次提取。
16. 最终上清液中添加0.1体积8 M氨酸乙酸,然后添加2体积的绝对乙醇。
17. 在-80°C下孵育60分钟,离心10分钟,8000-9000 g,弃去上清液,添加等体积70%乙醇,静置10分钟,离心10分钟,8000-9000 g,弃去上清液,真空干燥沉淀物30分钟。
18. 添加100-500 l 0.1X NTE,10 l RNase混合物,通常使用500 l per 50 g组织样本。
19. 在37°C下孵育30分钟。