背景介绍:
T4多核苷酸激酶(T4 Polynucleotide Kinase, T4 PNK)是一种常用的酶,能够催化寡核苷酸5'端的磷酸化反应,广泛应用于分子生物学实验中对寡核苷酸进行放射性或非放射性标记。通过标记后的寡核苷酸探针,可用于核酸杂交、足迹分析等多种实验技术。
实验步骤:
1. 在微量离心管中加入以下反应混合物:
- 2 μl 10X激酶缓冲液
- 3 μl [γ-32P] ATP(放射性标记,活度7000 Ci/mmol或167 Ci/μl,操作时需严格遵守放射性安全规范)
- 1 μl 牛血清白蛋白(BSA)
- 1 μl 寡核苷酸引物(浓度约50 ng/μl)
- 13 μl 超纯水(ddH2O)
- 30单位T4多核苷酸激酶(USB公司产品)
2. 将混合物在37℃孵育60分钟,使酶催化寡核苷酸5'端磷酸化。
3. 加入80 μl TE缓冲液(10 mM Tris,1 mM EDTA,pH 8.0)。
4. 在65℃孵育5分钟,终止反应。
5. 用25号针头在0.5 ml微量离心管底部戳两个小孔。
6. 加入约1毫米高度的玻璃珠以固定树脂。
7. 加入约150 μl G10凝胶过滤树脂,用于去除未结合的游离核苷酸。
8. 将含有玻璃珠和G10树脂的0.5 ml离心管放入1.5 ml离心管中。
9. 在临床离心机中以“6”档离心1.5分钟。
10. 弃去1.5 ml离心管底部流出液。
11. 重复离心步骤并弃液,确保去除游离核苷酸。
12. 将标记的DNA样品加载到树脂上。
13. 再次以“6”档离心3分钟。
14. 弃去含有未结合核苷酸的树脂柱。
15. 收集1.5 ml离心管底部的洗脱液,即为标记的寡核苷酸探针。
16. 将标记探针储存于-20℃以备后续实验使用。
缓冲液及试剂配方:
10X激酶缓冲液:使用前新鲜配制,含1 M MgCl2(10 μl)、100 mM亚精胺(10 μl)、0.5 M DTT(30 μl)、2 M Tris pH 7.6(33 μl)和超纯水(17 μl)。
TE缓冲液:10 mM Tris,1 mM EDTA,pH 8.0。
BSA:2 mg/ml牛血清白蛋白。
注意事项:
操作放射性同位素时必须严格遵守安全规程,避免污染和辐射伤害。实验过程中保持无RNA酶和DNA酶环境以保证寡核苷酸的完整性。G10树脂用于有效去除未结合的游离核苷酸,保证标记探针的纯度和特异性。
学术价值:该方法为分子生物学中标记寡核苷酸的经典技术,适用于核酸杂交、足迹分析及其他需要放射性探针的实验,具有操作简便、标记效率高的优点。