描述
本方案描述了一种利用酚和冷冻处理从酵母细胞中提取总RNA的方法。该方法通过酚抽提去除蛋白质,并利用冷冻步骤促进细胞裂解和RNA释放,适用于酵母等微生物的RNA提取。
步骤
1. 培养10 ml酵母至5×10^6细胞/ml。
2. 离心收集细胞,重悬于400 μl AE缓冲液中。
3. 将细胞转移至1.5 ml微量离心管,加入40 μl 10% SDS,涡旋混匀。
4. 加入等体积酚,涡旋,65°C孵育4分钟。
5. 将管迅速置于干冰/乙醇浴中冷却,直至酚晶体出现,室温离心2分钟。
6. 将水相转移至新管,加入等体积酚/氯仿/异戊醇,涡旋,室温离心5分钟。
7. 将水相转移至新管,加入1/10体积的3M乙酸钠(pH 5.3)和2.5倍体积乙醇,-20°C沉淀20分钟。
8. 沉淀RNA,用80%乙醇洗涤,空气干燥沉淀,重悬于20 μl水中。
配方
(DEPC处理:加入DEPC至0.1%,混匀过夜,高压灭菌以破坏DEPC)
DEPC处理水
AE缓冲液(DEPC处理):50 mM乙酸钠,pH 5.3;10 mM EDTA
10% SDS
用AE缓冲液平衡的酚
酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)
3M乙酸钠(pH 5.3,DEPC处理)
无RNase的95%乙醇(-20°C)
无RNase的80%乙醇
注意事项
所有溶液需使用DEPC处理水配制,并确保无RNase污染。操作过程中需佩戴手套,避免RNase污染。