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酚/冷冻法酵母RNA提取方案

2005-07-18 00:00 未知 未知 阅读 0
核心摘要: 本文详细描述了利用酚和冷冻处理从酵母细胞中提取总RNA的实验方案。步骤包括细胞培养、裂解、酚抽提、冷冻沉淀和RNA纯化。该方法适用于酵母等微生物的RNA提取,强调无RNase操作和DEPC处理。

描述

本方案描述了一种利用酚和冷冻处理从酵母细胞中提取总RNA的方法。该方法通过酚抽提去除蛋白质,并利用冷冻步骤促进细胞裂解和RNA释放,适用于酵母等微生物的RNA提取。

步骤

1. 培养10 ml酵母至5×10^6细胞/ml。

2. 离心收集细胞,重悬于400 μl AE缓冲液中。

3. 将细胞转移至1.5 ml微量离心管,加入40 μl 10% SDS,涡旋混匀。

4. 加入等体积酚,涡旋,65°C孵育4分钟。

5. 将管迅速置于干冰/乙醇浴中冷却,直至酚晶体出现,室温离心2分钟。

6. 将水相转移至新管,加入等体积酚/氯仿/异戊醇,涡旋,室温离心5分钟。

7. 将水相转移至新管,加入1/10体积的3M乙酸钠(pH 5.3)和2.5倍体积乙醇,-20°C沉淀20分钟。

8. 沉淀RNA,用80%乙醇洗涤,空气干燥沉淀,重悬于20 μl水中。

配方

(DEPC处理:加入DEPC至0.1%,混匀过夜,高压灭菌以破坏DEPC)

DEPC处理水

AE缓冲液(DEPC处理):50 mM乙酸钠,pH 5.3;10 mM EDTA

10% SDS

用AE缓冲液平衡的酚

酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)

3M乙酸钠(pH 5.3,DEPC处理)

无RNase的95%乙醇(-20°C)

无RNase的80%乙醇

注意事项

所有溶液需使用DEPC处理水配制,并确保无RNase污染。操作过程中需佩戴手套,避免RNase污染。

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