描述
本方案详细描述了使用玻璃珠破碎法从酵母细胞中提取总RNA的步骤。该方法适用于对数生长后期的酵母培养物,可有效获得高质量RNA,用于后续分子生物学实验。
实验步骤
1. 在20 ml培养基中培养酵母细胞至对数生长后期(约1×10⁷个细胞),可根据需要按比例扩大或缩小培养规模。
2. 将细胞转移至50 ml Falcon管中,使用Beckman台式离心机3000 rpm离心5分钟。
3. 用DEPC处理水洗涤沉淀。
4. 再次3000 rpm离心5分钟。沉淀可在-70°C下长期保存。
5. 用0.6 ml RNA提取缓冲液重悬沉淀。
6. 立即加入等体积的PCI(苯酚:氯仿:异戊醇=50:50:1),混匀。
7. 室温静置5-6分钟。
8. 在此期间,将混合物转移至13×100 mm玻璃管中。
9. 加入玻璃珠至有机相弯月面约3/4处,最大速度涡旋2分钟。
10. 将溶液转移至1.5 ml微量离心管中,离心分离相。
11. 用PCI抽提水相2次,再用SEVAG(氯仿:异戊醇=24:1)抽提1次(每次加入等体积)。
12. 加入0.1体积(约40 μl)3M NaOAc(pH 5.2)和2-3倍体积的冷95%乙醇,-20°C沉淀1小时。
13. 离心沉淀,用70%乙醇洗涤沉淀。
14. 用DEPC处理水(约30 μl)重悬,-70°C保存。
试剂配方
DEPC处理水:用0.1% DEPC处理去离子水,高压灭菌。
RNA提取缓冲液:0.1 M NaCl(DEPC处理),10 mM EDTA(DEPC处理),5% SDS(DEPC处理),50 mM Tris-HCl(pH 7.5,不可DEPC处理)。
PCI:苯酚:氯仿:异戊醇=50:50:1(体积比)。
SEVAG:氯仿:异戊醇=24:1(体积比)。
3M NaOAc(pH 5.2):DEPC处理。
无RNase的95%乙醇:-20°C预冷。
无RNase的70%乙醇:用DEPC处理水配制。
注意事项
所有溶液和器材需确保无RNase污染,操作过程中佩戴手套和口罩。玻璃珠使用前需用酸处理或DEPC处理以去除RNase。