2005年，中国科学院北京基因组研究所于军教授领导的研究团队在《PLoS Biology》上发表了一篇关于水稻基因组的研究论文，该论文于2006年2月1日被《The Scientist》杂志评为基因组学热点文章。该研究利用自主研发的计算程序，改进了印度水稻（籼稻）和日本水稻（粳稻）的基因组组装，并通过比较基因组序列揭示了水稻的进化历史。

研究结果显示，水稻基因组中约65.7%的序列由重复片段（duplicated segments）组成，这一比例高于预期。英国莱斯特大学的Pat Heslop-Harrison教授评论道：“重复基因和重复片段通常难以被精确拷贝，这可能导致基因组失衡。” 这一发现对理解植物基因组的稳定性和进化具有重要意义。

于军团队目前正利用微阵列技术（microarrays）分析杂交水稻品系，并将其基因组与亲本基因组进行比较。他们发现杂交水稻的产量比亲本高出20-25%，这一现象与杂种优势（heterosis）密切相关。Heslop-Harrison指出，这项研究为比较基因组学提供了重要工具，有助于研究其他植物的种间杂交。

参考文献：Yu et al., "The genomes of Oryza sativa: a history of duplications," PLoS Biol, 3: e38, 2005. (Cited in 74 papers)

于军教授简介

于军，教授，副所长，美国纽约大学博士。研究方向包括基因组组分动力学、基因产物识别、基因组变异与进化等。主要科研成果包括发现并命名了膀胱表皮特异膜蛋白Uroplakins，参与人类基因组计划，主持了腾冲泉生热孢菌基因组计划、人类基因组计划北京部分（1%计划）和中国杂交水稻基因组计划等。曾获CUSBEA奖学金、全美泌尿科疾病基金博士学者奖、中国科学院“百人计划”、香港求是科技基金会“求是杰出科技成就集体奖”、《科学美国人》全球科研领袖奖等荣誉。