流行性脑脊髓膜炎（简称流脑）是一种由脑膜炎奈瑟菌引起的严重传染病，其传播途径主要为飞沫传播。传统流行病学调查在追溯传染源时往往面临菌株变异和传播路径复杂的挑战。近年来，基因分析技术的应用为流脑传染源的追踪提供了新的科学手段。通过收集不同时间、不同地区的流脑流行株和非流行株，利用多位点酶电泳（MLEE）或全基因组测序等方法，可以揭示菌株间的遗传关系，从而追溯传染来源。

1986年，美国科学家首次应用多位点酶电泳法对1970年代中期以来在挪威及其他欧洲国家收集的460株B群和C群流脑菌株进行了系统分析。他们提取菌体酶进行水平淀粉凝胶电泳，利用不同底物显色，获得了不同的酶电泳型。通过计算基因距离并绘制遗传学图谱，研究者从460株菌株中鉴定出192个克隆型，其中22个克隆型密切相关，分别来自挪威、西班牙、智利、古巴、南非和美国等地的流行期。研究结论明确指出，1981—1982年美国迈阿密的流脑流行是由古巴移民传入的。

近年来，德国学者采用类似方法对1963年以来全球23次A群流脑流行及非流行株共424株进行了分析，发现其中7个克隆型是引起国际间传播的主要流行株。此外，研究还发现赞比亚1982—1985年间从患者分离的菌株均属于同一个克隆型，提示该地区可能存在持续的本地传播链。

由此可见，基因分析技术不仅能够研究国际范围内菌群传播流行的关系，还能揭示菌群间的遗传学联系，追溯首发及传入病例。在流脑流行病学中，该方法对于寻找传染源、制定精准防控策略具有重要意义。