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数千种细胞开关支持生命活动的研究

2008-07-06 11:11 Naren Ramakrishnan, PLoS Computational Biology 阅读 0
核心摘要: 研究表明,细胞使用数千种开关来支持其生命活动,这些开关决定细胞类型、感应外部压力并与其他细胞交流。该研究揭示了细胞开关的复杂性及其在信息传递中的重要性。

在我们的日常生活中,开关无处不在,比如早晨的闹钟、咖啡机和汽车的启动,直到晚上关灯入睡。然而,科学家的研究表明,单个活细胞的开关数量远远超过我们日常使用的开关数量。美国维吉尼亚技术学院的计算机科学副教授Naren Ramakrishnan与生物科学国家中心(NCBS)的Upinder S. Bhalla共同研究发现:细胞利用数千种开关来支持其重要的生命活动

细胞开关的多样性:这些开关不仅决定细胞的类型,例如血液细胞或皮肤细胞,还能感应和反馈外部压力,并与其他细胞进行交流。Bhalla表示:“一个细胞开关就像一个存储单元,开关的状态——开启或关闭,类似于计算机存储器中的比特0或1。尽管实际的生物开关非常复杂,控制方式也多种多样,但我们已经找到了一种方法,使它们能够在简单状态下工作。”

这项研究的合作始于Ramakrishnan对NCBS的访问。作为计算机科学家,他专注于数值模拟和数据挖掘,而Bhalla则是一位计算机神经学家,对生化网络建模和仿真有着广泛的兴趣。他们决定利用维吉尼亚技术学院的X系统超级计算机,检索细胞执行开关的多种方式。

Ramakrishnan表示:“我们使用的X系统更像是一个修补匠,或者是一个孩子在整理他们看到的东西,以判断它们是否有用。我们使用了许多‘零件’,每一个‘零件’代表一个化学反应,它们以各种方式相互连接。我们发现,这些人工构造的无数网络实际上都是‘开关’。”

研究者们指出,之前的观点认为生物学中细胞所使用的‘开关’数量很少,但他们的检索结果显示出数以千计的细胞开关。研究团队在《公共科学图书馆·计算生物学》(PLoS Computational Biology)上报道:“我们发现了接近4500种拓扑结构反应,或接近全部测试结构的10%被确定为具有开关行为。”

Bhalla补充道:“当然,对细胞而言,除了交换,还有许多其他功能。然而,信息的交换和存储是最基本的行为。我们现在可以进一步研究例如信息传递等复杂行为。”

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