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美研制出可设计基因片段的计算机程序

2006-02-28 09:10 未知 基因组研究杂志 阅读 0
核心摘要: 美国约翰·霍普金斯大学科学家研制出基于网络的自动化计算机程序GeneDesign,可简化基因片段设计过程。该程序已成功设计合成Ty1等基因序列,由6个模块组成,支持用户通过氨基酸或碱基序列输入自动完成设计。研究发表于《基因组研究》杂志,由美国国立卫生研究院资助。

据《基因组研究》杂志4月刊和2月中旬在线版的一篇文章报道,美国约翰·霍普金斯大学的科学家研制成功一种基于网络的自动化计算机程序“GeneDesign”。该程序能大大简化费时且易出错的人工基因片段设计过程。

到目前为止,研究人员已利用GeneDesign程序成功设计合成了许多基因序列,包括Ty1片段——酵母细胞中的一种运动性遗传片段。该片段可从一个酵母细胞中移出并插入到另一个酵母的染色体上。这种“跳跃式”运动能产生突变,为酵母引入附加的遗传物质。

GeneDesign由6个模块组成,可单独或一起自动完成基因序列的设计和处理工作。用户通过输入组成蛋白质的氨基酸序列或组成基因的碱基序列开始,接着按一系列步骤完成,也可以按主程序“基因设计”方式选择单个模块进行。

该研究的其他作者包括约翰·霍普金斯大学医学院的Sarah J. Wheelan和Robert M. Yarrington。该研究由美国国立卫生研究院资助。

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