2006年,美国得克萨斯州安德森癌症中心的生物统计学家凯思·巴格利(Keith Baggerly)和凯文·库姆斯(Kevin Coombes)在核查杜克大学一个著名研究小组的论文数据时,意外发现了一系列严重问题,最终引发了一场波及整个癌症研究领域的学术诚信风波。该事件的核心人物是杜克大学癌症研究人员安尔尼·波蒂(Anil Potti),他及其团队开发的通用肿瘤分析方法受到质疑,同时波蒂被指控在个人简历中编造“罗德斯学者”身份。据《科学》杂志报道,杜克大学已停止基于这些方法的临床试验,启动对波蒂及其研究的调查,并勒令其行政停职。事件还促使美国癌症协会中止了波蒂一项为期5年、总额72.9万美元的经费,并呼吁对癌症研究领域进行普查。
波蒂是杜克大学医学系和遗传科学及政策研究所的副教授,曾在印度基督教医学院获得医学博士学位,后加入杜克大学癌症遗传学家约瑟夫·尼温斯(Joseph Nevins)的实验室。2006年10月,波蒂和尼温斯在《自然—医学》期刊上发表论文,声称通过检测细胞系对特定药物的敏感性,可以预测多种癌症患者的治疗反应。基于此,杜克大学启动了三项临床试验(两项针对肺癌,一项针对乳腺癌),旨在利用基因表达签名(gene expression signature)指导个体化治疗。然而,安德森癌症中心的医生在尝试复制该方法时,要求生物统计学家巴格利和库姆斯仔细审查论文数据。
巴格利和库姆斯在2006年的论文中发现了多项错误,包括基因列表中包含不相关基因、肿瘤样品标记不准确等问题。他们与杜克大学作者沟通未获满意答复,随后于2007年向《自然—医学》投递通讯文章,详细说明问题,该文于2007年11月发表。然而,波蒂和尼温斯继续发表基于相同方法的论文,巴格利在后续论文中又发现新错误,并联系《柳叶刀—肿瘤学》和《临床肿瘤学期刊》,但期刊仅刊出部分修正,拒绝发表其来信。直到2010年7月,《癌症通讯》报道波蒂简历中编造“罗德斯学者”身份,事件才出现转机,杜克大学再次停止临床试验并启动正式调查。
约翰霍普金斯大学的流行病学家史蒂文·戈德曼(Steven Goodman)在得知此事后,鼓励巴格利将事件发表在重要期刊上。巴格利和库姆斯随后在《应用统计学年刊》上发表了批评文章,导致杜克大学一度中止试验,但2010年1月又恢复,直至波蒂履历问题曝光才最终停止。巴格利指出,事件暴露了校正科学记录的困难以及解读基因表达数据的复杂性。美国医学研究院国家癌症论坛负责人莎莉·纳斯(Sally Nus)呼吁未来应建立更好的机制避免类似问题。密歇根大学肺癌分子遗传学家大卫·比尔(David Beer)表示,杜克大学事件给学界带来伤害,但希望不会玷污整个基因表达研究领域。目前,杜克大学已启动全面的外部科学评估和正式调查,相关期刊也在进行内部审查。